293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3445 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  100 
 
 		 160 aa  329  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  96.25 
 
 		 160 aa  319  8e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  95.62 
 
 		 159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  88.12 
 
 		 160 aa  295  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  81.25 
 
 		 161 aa  280  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3765  bacterioferritin  81.01 
 
 		 159 aa  274  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  79.25 
 
 		 160 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  77.5 
 
 		 160 aa  268  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  69.38 
 
 		 161 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1763  bacterioferritin  70.44 
 
 		 165 aa  239  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.485772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2099  bacterioferritin  69.81 
 
 		 165 aa  237  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.475694  normal  0.211446 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0733  bacterioferritin  70.25 
 
 		 165 aa  237  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0113  bacterioferritin  69.81 
 
 		 165 aa  237  5.999999999999999e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.448352  normal  0.481068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1531  bacterioferritin  69.18 
 
 		 165 aa  235  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.572413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0355  bacterioferritin  66.24 
 
 		 159 aa  229  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1102  bacterioferritin  67.72 
 
 		 165 aa  228  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.298053  normal  0.435588 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  67.79 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  67.11 
 
 		 165 aa  208  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  67.55 
 
 		 161 aa  206  9e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  66.44 
 
 		 165 aa  204  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  64.43 
 
 		 161 aa  203  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0197  bacterioferritin  66.44 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1546  bacterioferritin  65.77 
 
 		 161 aa  201  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0565  bacterioferritin  61.39 
 
 		 161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0530  bacterioferritin  61.39 
 
 		 161 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3019  bacterioferritin  61.39 
 
 		 161 aa  197  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  62.25 
 
 		 161 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  62.91 
 
 		 161 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  59.75 
 
 		 161 aa  193  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  62.25 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  61.74 
 
 		 161 aa  186  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  54.49 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1812  bacterioferritin  56.05 
 
 		 158 aa  184  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  56.33 
 
 		 159 aa  183  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  56.29 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0430  bacterioferritin  56.95 
 
 		 154 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3046  bacterioferritin  54.14 
 
 		 158 aa  177  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2883  bacterioferritin  53.8 
 
 		 158 aa  177  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00559633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2370  bacterioferritin  53.8 
 
 		 158 aa  177  8e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.221991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1260  bacterioferritin  54.14 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120383 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04013  bacterioferritin  59.31 
 
 		 156 aa  174  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1374  bacterioferritin  51.27 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0599882  normal  0.159407 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  58.62 
 
 		 156 aa  172  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  53.9 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  52.32 
 
 		 159 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0976  bacterioferritin  50.63 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  53.9 
 
 		 159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  56.55 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2557  bacterioferritin  50.96 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0355687 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2059  bacterioferritin  52.26 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  56.55 
 
 		 154 aa  168  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1412  bacterioferritin  51.27 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.116857  normal  0.0696668 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1798  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0795  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0622  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.305078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1935  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1087  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.947252  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2021  bacterioferritin  52.9 
 
 		 224 aa  168  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607518  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0525  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5524  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3137  bacterioferritin  51.9 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232697  normal  0.0227872 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1942  bacterioferritin  50.97 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2220  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.01085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5882  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2195  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  50.33 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1081  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2113  bacterioferritin  52.9 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0195  bacterioferritin  50.97 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2234  bacterioferritin  52.26 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0137249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0587  bacterioferritin  51.61 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0350  bacterioferritin  53.25 
 
 		 159 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0355514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5073  bacterioferritin  50.64 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.66204  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  51.59 
 
 		 159 aa  163  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  51.66 
 
 		 157 aa  163  9e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  50 
 
 		 154 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1765  bacterioferritin  53.69 
 
 		 161 aa  162  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.472691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  50.65 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2727  bacterioferritin  53.55 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.678141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  51.27 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  51.27 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.290552 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  49.67 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6042  bacterioferritin  51.68 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3825  bacterioferritin  52.98 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000592786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4004  bacterioferritin  52.98 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000958722  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0206  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.142507  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2899  bacterioferritin  49.68 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.197703  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0225  bacterioferritin  50 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000531808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  51.95 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  47.74 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  51.3 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  51.3 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  51.3 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  51.3 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  49.35 
 
 		 159 aa  157  4e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>