38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0132 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  327  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  90.57 
 
 		 159 aa  303  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  91.45 
 
 		 152 aa  290  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  81.99 
 
 		 163 aa  274  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  81.94 
 
 		 160 aa  267  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  80.5 
 
 		 160 aa  266  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  77.5 
 
 		 163 aa  261  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  64.29 
 
 		 157 aa  203  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  62.5 
 
 		 164 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  61.74 
 
 		 161 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  60 
 
 		 164 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  61.31 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  61.48 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  61.48 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  57.78 
 
 		 164 aa  167  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  58.82 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  58.09 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  50.94 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  51.61 
 
 		 170 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  58.33 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  49.69 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  49.06 
 
 		 176 aa  153  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  50.66 
 
 		 180 aa  149  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  49.34 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  47.65 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  52.21 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  45.07 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  45.86 
 
 		 155 aa  124  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  47.37 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  45.93 
 
 		 155 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  45.19 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  45.45 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  42.42 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  39.04 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  42.47 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  42.11 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  38.71 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  41.32 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>