40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4887 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4887  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.180443  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1591  hypothetical protein  33.57 
 
 		 365 aa  153  5.9999999999999996e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.330641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3124  protein of unknown function DUF450  31.6 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579922  normal  0.419432 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1227  hypothetical protein  30.17 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.888396  normal  0.616229 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4251  protein of unknown function DUF450  34.04 
 
 		 378 aa  139  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1269  protein of unknown function DUF450  33.21 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0165219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6984  protein of unknown function DUF450  30.53 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00893267  hitchhiker  0.0000001532 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0837  conserved hypothetical protein (DUF450 domain protein)  33.79 
 
 		 347 aa  129  6e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000053845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2483  hypothetical protein  72.62 
 
 		 90 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.231291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0250  hypothetical protein  34.6 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.178621  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0499  hypothetical protein  33.71 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0768136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0309  hypothetical protein  27.63 
 
 		 395 aa  125  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0709  hypothetical protein  30.22 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2922  protein of unknown function DUF450  33.8 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1111  hypothetical protein  29.93 
 
 		 357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3350  protein of unknown function DUF450  30.97 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3617  hypothetical protein  35.08 
 
 		 363 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0961  hypothetical protein  31.06 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0478229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4039  hypothetical protein  33.1 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.400799  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03510  prophage Lp2 protein 6  32.73 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0242  protein of unknown function DUF450  30.86 
 
 		 370 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5317  protein of unknown function DUF450  30.11 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0984182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3692  hypothetical protein  30.57 
 
 		 362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.877955 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1853  hypothetical protein  29.54 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1326  hypothetical protein  31.12 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1839  hypothetical protein  29.54 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00358423  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1887  hypothetical protein  29.54 
 
 		 356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.132794  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0657  prophage Lp2 protein 6  30.85 
 
 		 245 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3005  hypothetical protein  32.31 
 
 		 351 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.826636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4924  hypothetical protein  32.22 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3361  putative restriction endonuclease or methylase  32.18 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3528  protein of unknown function DUF450  34.39 
 
 		 375 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0402721  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0879  type I restriction enzyme r protein (hsdr_n)  30.17 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000202052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0839  hypothetical protein  30.77 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51863  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0515  protein of unknown function DUF450  27.35 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0842  hypothetical protein  39.44 
 
 		 85 aa  54.7  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0510  hypothetical protein  29.55 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5242  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  29.75 
 
 		 974 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1841  HsdR family type I site-specific deoxyribonuclease  29.89 
 
 		 953 aa  44.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2474  type I restriction-modification system, R subunit  29.59 
 
 		 930 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.081777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>