39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4345 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  234  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  55.08 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3209  hypothetical protein  54.4 
 
 		 125 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.542631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2585  hypothetical protein  55.66 
 
 		 125 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.100754 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  37.68 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  55.41 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  54.05 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  45.35 
 
 		 148 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  38.84 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  49.32 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  51.35 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  50.68 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5927  protein of unknown function DUF1236  36.36 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1342  protein of unknown function DUF1236  44.19 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1184  hypothetical protein  43.02 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0429194 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  43.75 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2609  protein of unknown function DUF1236  37.7 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2804  protein of unknown function DUF1236  37.7 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2581  hypothetical protein  37.7 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0154  protein of unknown function DUF1236  43.24 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.285962 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0457  hypothetical protein  46.91 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.810784 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  42.5 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  42.5 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  29.66 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  30.83 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  31.36 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3907  protein of unknown function DUF1236  34.72 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  44.83 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  34.57 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  45.28 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5638  protein of unknown function DUF1236  34.57 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  39.73 
 
 		 131 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  42.5 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  33.7 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  43.4 
 
 		 139 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  34.85 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  30.59 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  30.59 
 
 		 221 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  42.59 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>