13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2917 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2917  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2223  hypothetical protein  74.77 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.692073  normal  0.323569 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2990  hypothetical protein  51.72 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.181047  normal  0.0324897 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2568  TonB-dependent receptor, putative  39.87 
 
 		 197 aa  93.2  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0359  TonB-dependent receptor, putative  37.24 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0337696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2401  TonB-dependent receptor, putative  31.9 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2215  hypothetical protein  42.35 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.231176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1461  TonB-dependent receptor, putative  29.89 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2500  TonB-like  30.34 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4815  hypothetical protein  30.34 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2907  secretin/TonB-like protein  30.21 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55330  hypothetical protein  28.97 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3129  secretin/TonB, short-like protein  35.87 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.828632  normal  0.319534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>