50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2286 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2286  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 		 128 aa  255  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1717  hypothetical protein  40.31 
 
 		 129 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.72371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0810  hypothetical protein  36.64 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2075  4-oxalocrotonate tautomerase  37.93 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.356466  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2634  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2590  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.538528  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2262  hypothetical protein  43.66 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2138  4-oxalocrotonate tautomerase  36.13 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3672  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4509  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0981308  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3855  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 		 127 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.243179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2241  4-oxalocrotonate tautomerase  34.68 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.280838  normal  0.0465075 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4401  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.037596 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3752  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.317279  normal  0.179922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3223  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.858973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4890  4-oxalocrotonate tautomerase  33.87 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100984  hitchhiker  0.0008433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2719  4-oxalocrotonate tautomerase  37.31 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3066  transglutaminase-like  27.88 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190826 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1002  transglutaminase-like  22.32 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00906021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8512  hypothetical protein  30.43 
 
 		 128 aa  50.1  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15050  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.143383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3211  4-oxalocrotonate tautomerase  29.69 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00825864 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1081  transglutaminase-like  25 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1736  4-oxalocrotonate tautomerase  35.29 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.223489  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3113  4-oxalocrotonate tautomerase  34.4 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2853  hypothetical protein  29.81 
 
 		 127 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2485  4-oxalocrotonate tautomerase  34.92 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0880519 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2646  acyloate catabolism-like protein  29.75 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.391983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0324  4-oxalocrotonate tautomerase  31.5 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1663  4-oxalocrotonate tautomerase  33.33 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0155634  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0292  tautomerase enzyme family protein  31.5 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0873  tautomerase enzyme family protein  31.5 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2571  tautomerase enzyme family protein  31.5 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1669  4-oxalocrotonate tautomerase  31.5 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3399  4-oxalocrotonate tautomerase  31.73 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1472  4-oxalocrotonate tautomerase  31.5 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.329573  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2435  4-oxalocrotonate tautomerase  31.5 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.119976  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4668  4-oxalocrotonate tautomerase  28.43 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.744907  normal  0.547814 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0509  4-oxalocrotonate tautomerase  26.92 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.380197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3586  4-oxalocrotonate tautomerase  30.89 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398281  normal  0.0590497 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2211  4-oxalocrotonate tautomerase  33.6 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00393274  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3285  4-oxalocrotonate tautomerase  30.4 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0880  4-oxalocrotonate tautomerase  40.32 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0588  tautomerase enzyme family protein  33.06 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2767  4-oxalocrotonate tautomerase  29.27 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4181  4-oxalocrotonate tautomerase  25.96 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.668909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2627  hypothetical protein  48.72 
 
 		 82 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100984  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01664  4-oxalocrotonate tautomerase  36.54 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0585706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4561  4-oxalocrotonate tautomerase  25.96 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0161169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1617  4-oxalocrotonate tautomerase family enzyme  37.93 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>