84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1508 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 159 aa  318  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1385  flagellar basal body-associated protein FliL  62.75 
 
 		 190 aa  192  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5508  flagellar basal body-associated protein FliL  60.14 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1123  flagellar basal body-associated protein FliL  55.21 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4421  flagellar basal body-associated protein FliL  62.16 
 
 		 166 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1685  flagellar basal body-associated protein FliL  64.52 
 
 		 167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3785  flagellar basal body-associated protein FliL  63.28 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3247  flagellar basal body-associated protein FliL  49.07 
 
 		 192 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3049  flagellar basal body-associated protein FliL  48.34 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.971745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3273  flagellar basal body-associated protein FliL  48.34 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4199  flagellar basal body-associated protein FliL  45.58 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.742849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0821  flagellar basal body-associated protein FliL  41.81 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  hitchhiker  0.00870301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4714  flagellar basal body-associated protein FliL  47.97 
 
 		 221 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2563  flagellar basal body-associated protein FliL  40.83 
 
 		 167 aa  111  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1433  flagellar basal body-associated protein FliL  44 
 
 		 203 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2841  flagellar basal body-associated protein FliL  41.58 
 
 		 196 aa  87.8  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1945  flagellar basal body-associated protein FliL  32.45 
 
 		 196 aa  67.4  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2973  flagellar basal body-associated protein FliL  29.61 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1313  flagellar synthesis protein  29.61 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2948  flagellar basal body-associated protein FliL  26.67 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577477  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  34.69 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  29.29 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  26.59 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2746  flagellar basal body-associated protein FliL  29.14 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  31.14 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1401  flagellar basal body-associated protein FliL  25.33 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3483  flagellar basal body-associated protein FliL  30.38 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0986992  normal  0.0557306 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  34.91 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3828  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  32.26 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  32.26 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  28.95 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0783  flagellar basal body-associated protein FliL  29.23 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16760  flagellar basal body-associated protein FliL  23.91 
 
 		 145 aa  50.8  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431059  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3912  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0271549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3263  flagellar basal body-associated protein FliL  35.37 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  28.14 
 
 		 174 aa  48.5  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  25.95 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0697  flagellar basal body-associated protein FliL  32.93 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0961891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  24 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  32.1 
 
 		 173 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  24.26 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  31.62 
 
 		 171 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2013  flagellar basal body-associated protein FliL  27.55 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1756  flagellar basal body-associated protein FliL  34.04 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  28.98 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  30.29 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  26.52 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4181  flagellar basal body-associated protein FliL  26.32 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  25.58 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  27.78 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  30.71 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  25.95 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  32.52 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  27.78 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  26.44 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  26.67 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  27.93 
 
 		 175 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0767  flagellar basal body-associated protein FliL  27.19 
 
 		 187 aa  44.3  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.577701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  28.22 
 
 		 174 aa  43.9  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  27.84 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  28.41 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3225  flagellar basal body-associated protein FliL  30.77 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.139211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  26.47 
 
 		 183 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0033  flagellar basal body-associated protein FliL  30.77 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1288  flagellar basal body-associated protein FliL  30.12 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0042  flagellar basal body-associated protein FliL  30.77 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.200475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 165 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2291  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 175 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.942777 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0044  flagellar basal body-associated protein FliL  30.77 
 
 		 177 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  28.74 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2684  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0028  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1868  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3498  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0239  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2765  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 		 180 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0060  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1121  flagellar basal body-associated protein FliL  24.49 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0041  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0029  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  27.7 
 
 		 167 aa  40.8  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2914  flagellar basal body-associated protein FliL  29.31 
 
 		 169 aa  40.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.667538  normal  0.215161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>