62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1385 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1385  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
190 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1123  flagellar basal body-associated protein FliL  78.66 
 
 
162 aa  254  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5508  flagellar basal body-associated protein FliL  71.43 
 
 
164 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389003  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  63.82 
 
 
159 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1685  flagellar basal body-associated protein FliL  66.94 
 
 
167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4421  flagellar basal body-associated protein FliL  67.74 
 
 
166 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3785  flagellar basal body-associated protein FliL  57.32 
 
 
167 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3247  flagellar basal body-associated protein FliL  46.2 
 
 
192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4199  flagellar basal body-associated protein FliL  44.97 
 
 
166 aa  121  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4714  flagellar basal body-associated protein FliL  45.81 
 
 
221 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3273  flagellar basal body-associated protein FliL  50.99 
 
 
172 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3049  flagellar basal body-associated protein FliL  50.99 
 
 
172 aa  117  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.971745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0821  flagellar basal body-associated protein FliL  40.45 
 
 
184 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  hitchhiker  0.00870301 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1433  flagellar basal body-associated protein FliL  47.47 
 
 
203 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2563  flagellar basal body-associated protein FliL  44.19 
 
 
167 aa  98.2  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.549847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2841  flagellar basal body-associated protein FliL  39.82 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  28.81 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  32.28 
 
 
158 aa  67.8  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1945  flagellar basal body-associated protein FliL  28.65 
 
 
196 aa  58.2  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608985  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  31.08 
 
 
158 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  28.26 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  29.14 
 
 
166 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2948  flagellar basal body-associated protein FliL  28.24 
 
 
174 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577477  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3483  flagellar basal body-associated protein FliL  28.89 
 
 
190 aa  54.7  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0986992  normal  0.0557306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  30.95 
 
 
166 aa  54.7  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  30.61 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2013  flagellar basal body-associated protein FliL  24.11 
 
 
142 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0783  flagellar basal body-associated protein FliL  29.32 
 
 
159 aa  52.8  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  24.29 
 
 
167 aa  52.4  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2973  flagellar basal body-associated protein FliL  28.29 
 
 
162 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1313  flagellar synthesis protein  28.29 
 
 
162 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1401  flagellar basal body-associated protein FliL  25.32 
 
 
144 aa  51.6  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  25.68 
 
 
175 aa  51.2  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  27.7 
 
 
174 aa  51.2  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  27.7 
 
 
174 aa  51.2  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16760  flagellar basal body-associated protein FliL  22.38 
 
 
145 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431059  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  27.13 
 
 
161 aa  48.9  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2335  flagellar basal body-associated protein FliL  35.71 
 
 
149 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0372257  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0767  flagellar basal body-associated protein FliL  29.82 
 
 
187 aa  48.1  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.577701  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0026  flagellar basal body-associated protein FliL  27.07 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  26.16 
 
 
167 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4389  flagellar basal body-associated protein FliL  26.87 
 
 
222 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1756  flagellar basal body-associated protein FliL  28.7 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2746  flagellar basal body-associated protein FliL  27.16 
 
 
161 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3263  flagellar basal body-associated protein FliL  33 
 
 
166 aa  46.2  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  25.16 
 
 
199 aa  45.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  25.62 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2491  flagellar basal body-associated protein FliL  27.62 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2587  flagellar basal body-associated protein FliL  27.62 
 
 
167 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0942094  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 
164 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  27.61 
 
 
164 aa  45.1  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1366  flagellar basal body-associated protein FliL  26.13 
 
 
167 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
173 aa  44.3  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1102  flagellar basal body-associated protein FliL  25.6 
 
 
147 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478744  normal  0.739115 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0697  flagellar basal body-associated protein FliL  28.46 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0961891  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0143  putative flagellar protein FliL  28.29 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  29.29 
 
 
179 aa  43.9  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0159  flagellar protein FliL, putative  28.29 
 
 
163 aa  43.5  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  24.53 
 
 
167 aa  42.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1682  flagellar basal body-associated protein FliL  23.68 
 
 
135 aa  42.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  22.41 
 
 
178 aa  42  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  22.97 
 
 
179 aa  41.2  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>