75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4421 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4421  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 
166 aa  330  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3785  flagellar basal body-associated protein FliL  82.63 
 
 
167 aa  241  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1685  flagellar basal body-associated protein FliL  87.9 
 
 
167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  59.88 
 
 
159 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1385  flagellar basal body-associated protein FliL  60 
 
 
190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5508  flagellar basal body-associated protein FliL  66.89 
 
 
164 aa  190  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389003  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1123  flagellar basal body-associated protein FliL  55.62 
 
 
162 aa  184  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3247  flagellar basal body-associated protein FliL  50.31 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3049  flagellar basal body-associated protein FliL  49.01 
 
 
172 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.971745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3273  flagellar basal body-associated protein FliL  49.01 
 
 
172 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4199  flagellar basal body-associated protein FliL  45.64 
 
 
166 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.742849  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0821  flagellar basal body-associated protein FliL  41.76 
 
 
184 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  hitchhiker  0.00870301 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4714  flagellar basal body-associated protein FliL  47.2 
 
 
221 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1433  flagellar basal body-associated protein FliL  48.48 
 
 
203 aa  105  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2563  flagellar basal body-associated protein FliL  43.41 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.549847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2841  flagellar basal body-associated protein FliL  43.56 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1945  flagellar basal body-associated protein FliL  33.51 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608985  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  32.32 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  27.59 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  30.92 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  34.46 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  35.71 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0783  flagellar basal body-associated protein FliL  30.53 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16760  flagellar basal body-associated protein FliL  24.68 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  30.86 
 
 
167 aa  59.7  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  32.1 
 
 
158 aa  59.3  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  26.59 
 
 
175 aa  57.4  0.00000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  29.01 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3483  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 
190 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0986992  normal  0.0557306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  28.99 
 
 
168 aa  54.7  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1313  flagellar synthesis protein  28.49 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2973  flagellar basal body-associated protein FliL  28.49 
 
 
162 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  32.12 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 
199 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  32.65 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  32.65 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2948  flagellar basal body-associated protein FliL  23.53 
 
 
174 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577477  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  29.58 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0697  flagellar basal body-associated protein FliL  35.33 
 
 
157 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0961891  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  30 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  30.08 
 
 
210 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  29.19 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  29.94 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  31.78 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  29.19 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4389  flagellar basal body-associated protein FliL  28.36 
 
 
222 aa  45.4  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2036  flagellar basal body-associated protein FliL  29.77 
 
 
148 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.339688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1756  flagellar basal body-associated protein FliL  32.98 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1401  flagellar basal body-associated protein FliL  26.53 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0467  flagellar basal body-associated protein FliL  31.45 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182844  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  29.75 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1682  flagellar basal body-associated protein FliL  26.4 
 
 
135 aa  44.7  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0159  flagellar protein FliL, putative  29.19 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0143  putative flagellar protein FliL  29.19 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2587  flagellar basal body-associated protein FliL  26.21 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0942094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0644  flagellar basal body-associated protein FliL  34.74 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1404  flagellar basal body-associated protein FliL  24.81 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28248  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  34.19 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2491  flagellar basal body-associated protein FliL  26.21 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1188  flagellar basal body-associated protein FliL  27.27 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  30 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1630  flagellar basal body-associated protein FliL  24.39 
 
 
179 aa  42.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1366  flagellar basal body-associated protein FliL  25.24 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662135  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  29.41 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02881  flagellar basal body-associated protein FliL  29.26 
 
 
179 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0413  flagellar basal body-associated protein FliL  29.7 
 
 
200 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2746  flagellar basal body-associated protein FliL  25.15 
 
 
161 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  28.8 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0853  flagellar basal body-associated protein FliL  28.28 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.325723  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  29.36 
 
 
167 aa  41.6  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  25 
 
 
178 aa  41.6  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  31.75 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  30.4 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  27.22 
 
 
179 aa  40.4  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>