83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3785 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3785  flagellar basal body-associated protein FliL  100 
 
 		 167 aa  334  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1685  flagellar basal body-associated protein FliL  90.32 
 
 		 167 aa  234  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0421417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4421  flagellar basal body-associated protein FliL  83.87 
 
 		 166 aa  217  5e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1508  flagellar basal body-associated protein FliL  59.88 
 
 		 159 aa  197  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1123  flagellar basal body-associated protein FliL  55.69 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.484196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5508  flagellar basal body-associated protein FliL  66.44 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1385  flagellar basal body-associated protein FliL  56.1 
 
 		 190 aa  184  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3247  flagellar basal body-associated protein FliL  52.17 
 
 		 192 aa  140  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3049  flagellar basal body-associated protein FliL  50.98 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.971745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3273  flagellar basal body-associated protein FliL  50.98 
 
 		 172 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0821  flagellar basal body-associated protein FliL  44.44 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.726598  hitchhiker  0.00870301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4199  flagellar basal body-associated protein FliL  42.95 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.742849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4714  flagellar basal body-associated protein FliL  45.78 
 
 		 221 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.2003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2563  flagellar basal body-associated protein FliL  40 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1433  flagellar basal body-associated protein FliL  47.47 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.804262 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2841  flagellar basal body-associated protein FliL  45.54 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1945  flagellar basal body-associated protein FliL  31.55 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0580  flagellar basal body-associated protein FliL  28.82 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3569  flagellar basal body-associated protein FliL  30.87 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1170  flagellar basal body-associated protein  30.11 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1637  flagellar basal body-associated protein FliL  35.71 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.600168  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1606  flagellar basal body-associated protein FliL  31.98 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.57906  normal  0.0493559 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16760  flagellar basal body-associated protein FliL  25.81 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431059  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1710  flagellar basal body-associated protein FliL  28.4 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0923  flagellar basal body-associated protein FliL  26.86 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.102944  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3483  flagellar basal body-associated protein FliL  35.56 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0986992  normal  0.0557306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002821  flagellar biosynthesis protein FliL  30.49 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3586  flagellar protein FliL  29.86 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.89846  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2948  flagellar basal body-associated protein FliL  26.63 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.577477  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0556  flagellar basal body-associated protein FliL  29.5 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4389  flagellar basal body-associated protein FliL  28.36 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0783  flagellar basal body-associated protein FliL  29.01 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06191  flagellar basal body-associated protein FliL  31.93 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0878348  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00975  flagellar basal body-associated protein FliL  31.93 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0814327  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1372  flagellar basal body-associated protein FliL  29.19 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0654602  normal  0.402549 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0653  flagellar basal body-associated protein FliL  29.81 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1972  flagellar basal body-associated protein FliL  25.71 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.824881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2973  flagellar basal body-associated protein FliL  27.27 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1313  flagellar synthesis protein  27.27 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.136593  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1327  flagellar basal body-associated protein FliL  31.76 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0697  flagellar basal body-associated protein FliL  34.76 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0961891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1401  flagellar basal body-associated protein FliL  26.67 
 
 		 144 aa  51.2  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2302  flagellar basal body-associated protein FliL  31.98 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3885  flagellar basal body-associated protein FliL  31.18 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0323637  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3060  flagellar basal body-associated protein FliL  27.95 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0042028  normal  0.0913138 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0860  flagellar protein (FliL)-like protein  30.14 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3075  flagellar basal body-associated protein FliL  43.27 
 
 		 190 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10365  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2816  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 		 173 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0470696 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1351  flagellar basal body-associated protein FliL  28.99 
 
 		 166 aa  47.8  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.516143  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0571  flagellar basal body-associated protein  27.54 
 
 		 210 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2570  flagellar basal body-associated protein FliL  29.27 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1119  flagellar basal body-associated protein FliL  28.24 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.220655 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3436  flagellar basal body-associated protein FliL  28.57 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1756  flagellar basal body-associated protein FliL  32.98 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3062  flagellar basal body-associated protein FliL  28.23 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2920  flagellar basal body-associated protein FliL  29.82 
 
 		 175 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.972456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3448  flagellar basal body-associated protein FliL  34.17 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0644  flagellar basal body-associated protein FliL  33.33 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45810  flagellar basal body-associated protein FliL  33.04 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3294  flagellar basal body-associated protein FliL  26.47 
 
 		 183 aa  44.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3222  flagellar basal body-associated protein FliL  29.82 
 
 		 174 aa  44.7  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1443  flagellar basal body-associated protein FliL  27.42 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.251302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0143  putative flagellar protein FliL  27.78 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1545  flagellar basal body-associated protein FliL  32.35 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0541868  normal  0.506273 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1366  flagellar basal body-associated protein FliL  22.52 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662135  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4181  flagellar basal body-associated protein FliL  23.08 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0159  flagellar protein FliL, putative  27.78 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.881437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1404  flagellar basal body-associated protein FliL  24.03 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.28248  normal  0.974806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1624  flagellar basal body-associated protein FliL  28.46 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1682  flagellar basal body-associated protein FliL  27.66 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03155  flagellar basal body-associated protein FliL  26.54 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3801  flagellar basal body-associated protein FliL  38.36 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0931816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4753  flagellar basal body-associated protein FliL  27.82 
 
 		 164 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.887693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1348  flagellar basal body-associated protein FliL  30.69 
 
 		 174 aa  42  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.298791 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3676  flagellar basal body-associated protein FliL  27.82 
 
 		 164 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.814795 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0853  flagellar basal body-associated protein FliL  29.37 
 
 		 156 aa  42  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.325723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2930  flagellar basal body-associated protein FliL  27.2 
 
 		 175 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0467  flagellar basal body-associated protein FliL  33.66 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.182844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2587  flagellar basal body-associated protein FliL  24.75 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0942094  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2491  flagellar basal body-associated protein FliL  24.75 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1320  flagellar basal body-associated protein FliL  23.93 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0264374  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2036  flagellar basal body-associated protein FliL  30.3 
 
 		 148 aa  41.2  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.339688  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0879  flagellar basal body-associated protein FliL  26.03 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0792203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>