More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4421 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  100 
 
 		 399 aa  808    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0666  peptidase M24  53.54 
 
 		 395 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0663  peptidase M24  39.93 
 
 		 387 aa  193  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2365  peptidase M24  31.27 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  32.4 
 
 		 376 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  33.33 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  33.33 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2242  putative endopeptidase  30.77 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.193239  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2132  putative endopeptidase  30.77 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2140  putative endopeptidase  30.26 
 
 		 405 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332227  normal  0.318783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  32.92 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  30.75 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  25.31 
 
 		 356 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  25.06 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0248  peptidase M24  30.11 
 
 		 366 aa  125  1e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  24.81 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  24.81 
 
 		 356 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  24.31 
 
 		 356 aa  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  24.81 
 
 		 356 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  24.81 
 
 		 356 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2395  peptidase M24  30.13 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.305736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  24.81 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  25.06 
 
 		 356 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  30.73 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  30.73 
 
 		 351 aa  119  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1051  peptidase M24  24.94 
 
 		 357 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000093282  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  24.31 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3437  peptidase M24  35.02 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  28.57 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1652  peptidase M24  32.89 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329498  hitchhiker  0.00124152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4452  peptidase M24  29.15 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0539466  hitchhiker  0.000000869693 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0545  aminopeptidase P  26.18 
 
 		 357 aa  113  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0397  peptidase M24  22.54 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1094  proline dipeptidase  29.46 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3953  peptidase M24  29.66 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.381963  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.32 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  26.32 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  26.32 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0574  Mername-AA019 peptidase  26.03 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  26.32 
 
 		 365 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  26.32 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  23 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  26.32 
 
 		 365 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  29.92 
 
 		 347 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0674  peptidase M24  29.66 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  26.32 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1282  peptidase M24  27.86 
 
 		 336 aa  110  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  26.32 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  26.32 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2086  peptidase M24  27.52 
 
 		 323 aa  110  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.165828 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  22.81 
 
 		 358 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1836  peptidase M24  28.69 
 
 		 323 aa  109  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00017843 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  25.56 
 
 		 365 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1697  peptidase M24  29.69 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1454  putative Xaa-Pro aminopeptidase  24.94 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.156054  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1929  peptidase M24  26.17 
 
 		 356 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_622  Xaa-Pro aminopeptidase  24.81 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05170  Xaa-Pro aminopeptidase  24.24 
 
 		 379 aa  107  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3098  peptidase M24  34.47 
 
 		 376 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.240373 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1224  peptidase M24  27.9 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1087  peptidase M24  30.23 
 
 		 348 aa  106  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.338834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  24.5 
 
 		 353 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  27.53 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1126  peptidase M24  29.67 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.643956  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  27.18 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  27.18 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  27.18 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  27.18 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  26.32 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  27.18 
 
 		 353 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  27.18 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  27.18 
 
 		 353 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  26.83 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0299  peptidase M24  25 
 
 		 355 aa  104  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1829  peptidase M24  27.2 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0269  peptidase M24  28.69 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.106169 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0435  proline dipeptidase  26.32 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000870779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1621  peptidase M24  28.74 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0238018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1588  peptidase M24  28.74 
 
 		 353 aa  103  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0608501  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0452  peptidase M24  29.57 
 
 		 361 aa  103  5e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  29.03 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  27.7 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1717  aminopeptidase P; XAA-pro aminopeptidase  24.62 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.338445  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2856  peptidase M24  30.26 
 
 		 358 aa  103  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.296278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  29.2 
 
 		 353 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2480  peptidase M24  33.19 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.191193  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2525  peptidase M24  33.19 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.186196  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_002936  DET0715  M24 family metallopeptidase  26.46 
 
 		 362 aa  102  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.775303  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15500  Xaa-Pro aminopeptidase  30.29 
 
 		 364 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.615325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1893  peptidase M24  27.37 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  30.95 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0650  peptidase M24  25.68 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2517  peptidase M24  32.76 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.60769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2591  peptidase M24  30.68 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.653697  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl379  Xaa-Pro-dipeptidase  27.44 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0116957  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1036  peptidase M24  25.07 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.660933  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0478  peptidase M24  26.18 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4628  peptidase M24  25.52 
 
 		 367 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.160287  hitchhiker  0.00355982 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4994  peptidase M24  26.84 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12124  dipeptidase pepE  33.61 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0941811  normal  0.718937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>