More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2874 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_2874  phosphopantetheine adenylyltransferase  100 
 
 
165 aa  337  5e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.226706  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2598  phosphopantetheine adenylyltransferase  93.94 
 
 
165 aa  322  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.550477  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2871  phosphopantetheine adenylyltransferase  89.02 
 
 
169 aa  304  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.658562  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1766  phosphopantetheine adenylyltransferase  83.64 
 
 
165 aa  289  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.66348  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1799  phosphopantetheine adenylyltransferase  77.58 
 
 
165 aa  272  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195414  normal  0.107346 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4369  phosphopantetheine adenylyltransferase  78.53 
 
 
164 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223414 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2588  phosphopantetheine adenylyltransferase  84.24 
 
 
165 aa  270  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.14268  normal  0.384811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4569  phosphopantetheine adenylyltransferase  70.55 
 
 
167 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.967829  normal  0.107284 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5029  phosphopantetheine adenylyltransferase  70.55 
 
 
167 aa  231  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0456512 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5193  phosphopantetheine adenylyltransferase  67.07 
 
 
166 aa  228  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2150  phosphopantetheine adenylyltransferase  66.46 
 
 
167 aa  225  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198888  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5087  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.52 
 
 
167 aa  224  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3787  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  67.7 
 
 
169 aa  223  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.403122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4459  phosphopantetheine adenylyltransferase  68.29 
 
 
166 aa  215  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0064993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1402  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.73 
 
 
166 aa  203  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1748  phosphopantetheine adenylyltransferase  61.39 
 
 
164 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18452 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1056  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.75 
 
 
164 aa  197  7e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1095  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.75 
 
 
164 aa  197  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.756098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1934  phosphopantetheine adenylyltransferase  59.49 
 
 
164 aa  193  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2445  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.13 
 
 
164 aa  192  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2180  phosphopantetheine adenylyltransferase  58.75 
 
 
164 aa  191  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1264  phosphopantetheine adenylyltransferase  57.59 
 
 
181 aa  190  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00933319  normal  0.787413 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2344  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.7 
 
 
167 aa  188  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0738  phosphopantetheine adenylyltransferase  53.75 
 
 
169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105274  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3551  phosphopantetheine adenylyltransferase  55.56 
 
 
167 aa  169  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3050  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  48.17 
 
 
170 aa  168  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.490282  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1178  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  47.65 
 
 
169 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1392  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.746303 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2960  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
162 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0216484  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1606  phosphopantetheine adenylyltransferase  46.58 
 
 
162 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0491468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1872  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.07 
 
 
162 aa  147  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0420385  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4476  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.83 
 
 
164 aa  147  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1916  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.56 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2870  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0221222 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1744  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.72 
 
 
171 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0541  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.33 
 
 
169 aa  142  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00492911  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0740  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.62 
 
 
165 aa  140  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1322  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  41.1 
 
 
163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.125584  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2991  phosphopantetheine adenylyltransferase  45.06 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00755722  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3516  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2839  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.601234  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0023  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.25 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.567178  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2252  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.21 
 
 
170 aa  137  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0603584  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3575  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.51 
 
 
160 aa  137  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.46415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1743  phosphopantetheine adenylyltransferase  43.21 
 
 
172 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.796142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2193  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.24 
 
 
168 aa  136  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3599  CheW protein  42.33 
 
 
181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0853169 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3956  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.61 
 
 
159 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.265028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2655  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.72 
 
 
174 aa  134  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0121775 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1880  phosphopantetheine adenylyltransferase  36.71 
 
 
160 aa  134  5e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0641897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2734  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.1 
 
 
165 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.715247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4191  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.82 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5123  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.42 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4969  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  40.74 
 
 
170 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.1 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1667  coenzyme A biosynthesis protein  44.65 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4997  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.42 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5173  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.82 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0342  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.82 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1736  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.27 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1564  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  40.24 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1434  phosphopantetheine adenylyltransferase  44.03 
 
 
164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.513834 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0590  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.89 
 
 
170 aa  132  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4758  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.82 
 
 
159 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0794015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0256  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  41.46 
 
 
162 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.444043  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0106  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  37.42 
 
 
161 aa  131  3e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0691876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4368  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  42.77 
 
 
167 aa  132  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0066  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  41.21 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3942  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.26 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.137281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1732  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00311  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.51 
 
 
168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0609  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.89 
 
 
168 aa  131  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0380  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.77 
 
 
160 aa  131  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.848582  hitchhiker  0.0082896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3926  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.46 
 
 
168 aa  131  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0004  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  41.61 
 
 
162 aa  130  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1109  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.88 
 
 
165 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.586457  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0115  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.61 
 
 
166 aa  130  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.71709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0417  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  41.21 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5348  phosphopantetheine adenylyltransferase  41.82 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0914491  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3692  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.51 
 
 
158 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3888  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.88 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3983  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.88 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.119096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4091  phosphopantetheine adenylyltransferase  39.88 
 
 
163 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1243  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.8 
 
 
164 aa  130  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.235235  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1015  phosphopantetheine adenylyltransferase  42.94 
 
 
167 aa  130  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0071  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  38.41 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4005  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.65 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0403849  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0077  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.41 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000860074  hitchhiker  0.0000013674 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4051  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.65 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.979837  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0329  phosphopantetheine adenylyltransferase  34.97 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.711951  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3924  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.65 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00616053  hitchhiker  0.00140553 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3969  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.41 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000330277  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3869  pantetheine-phosphate adenylyltransferase  43.21 
 
 
167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0737  phosphopantetheine adenylyltransferase  37.74 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.724641  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5004  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.41 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000254595  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03443  hypothetical protein  38.41 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0511611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2065  phosphopantetheine adenylyltransferase  40.12 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0496665  normal  0.697184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04760  phosphopantetheine adenylyltransferase  40 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.918574  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3843  phosphopantetheine adenylyltransferase  38.41 
 
 
159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000107042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>