More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0095 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  87.55 
 
 		 486 aa  870    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  872    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  872    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  872    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  871    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  871    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  871    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  872    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  87.55 
 
 		 486 aa  870    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  871    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  871    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  871    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  87.76 
 
 		 486 aa  872    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  100 
 
 		 472 aa  983    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  85.38 
 
 		 472 aa  849    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  85.38 
 
 		 472 aa  849    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  42.83 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  44.33 
 
 		 482 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  42.83 
 
 		 481 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  43.64 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  43.64 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  42.02 
 
 		 481 aa  365  1e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  41.56 
 
 		 478 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  41.6 
 
 		 481 aa  361  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  41.14 
 
 		 478 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  44 
 
 		 478 aa  359  5e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  41.56 
 
 		 473 aa  358  9.999999999999999e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  42.53 
 
 		 482 aa  351  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  38.19 
 
 		 477 aa  342  5.999999999999999e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  42.92 
 
 		 479 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  42.92 
 
 		 479 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  42.92 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  42.92 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  38.95 
 
 		 499 aa  306  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  41.88 
 
 		 390 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  41.36 
 
 		 334 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  37.18 
 
 		 351 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  44.74 
 
 		 249 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  48.09 
 
 		 195 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  43.21 
 
 		 251 aa  192  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  40.78 
 
 		 275 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  51.95 
 
 		 150 aa  160  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0251  ISBma2, transposase  29.54 
 
 		 514 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.869228  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3521  transposase  29.54 
 
 		 482 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3216  ISBma2, transposase  29.54 
 
 		 487 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.450921  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0217  ISBma2, transposase  29.54 
 
 		 493 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  29.6 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2607  transposase  29.54 
 
 		 493 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0639389  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0846  ISBma2, transposase  29.92 
 
 		 487 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.97464  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1722  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 580 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2951  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 550 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0779698  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2002  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 607 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0168  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0381  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.653097  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0388  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0426  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2779  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 537 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0728  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0457803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1500  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.777312  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1503  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.596952  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2643  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1715  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.893939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1718  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288863  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2278  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000228455  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2563  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.802734  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2753  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2790  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0388897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2803  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0263738  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2912  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.199238  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2982  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3200  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 514 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3182  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3239  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3291  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3361  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0170  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0332  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3324  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0878  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.941052  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1121  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1506  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1804  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198465  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1968  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2075  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2116  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0595075  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2252  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0484  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0026  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 509 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.462908  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0191  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2570  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 516 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.647466  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1522  transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1508  transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.948339  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2522  transposase  29.32 
 
 		 497 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.981989  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2335  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0367597  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0573  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127326  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0123  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 487 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00838697  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0801  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0988  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171105  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1102  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 493 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1342  ISBma2, transposase  29.32 
 
 		 538 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>