More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0711 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0711  2-octaprenylphenol hydroxylase  100 
 
 		 553 aa  1122    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0783  hypothetical protein  79.93 
 
 		 552 aa  927    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0686  hypothetical protein  96.75 
 
 		 553 aa  1095    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0061  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.78 
 
 		 558 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1207  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.9 
 
 		 553 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.842555  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0745  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.26 
 
 		 547 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0071  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.88 
 
 		 553 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3958  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.33 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4887  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.4 
 
 		 540 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0595  2-octaprenylphenol hydroxylase  40.89 
 
 		 540 aa  364  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.294006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0521  2-octaprenylphenol hydroxylase  44.5 
 
 		 527 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.25 
 
 		 547 aa  363  4e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4359  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.58 
 
 		 546 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4299  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.58 
 
 		 546 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.128892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4180  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.58 
 
 		 546 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.944164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4252  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.58 
 
 		 546 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4203  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.58 
 
 		 546 aa  362  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0452  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  43.3 
 
 		 539 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.755983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0321  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.21 
 
 		 546 aa  362  8e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5804  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.79 
 
 		 533 aa  362  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66920  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.35 
 
 		 533 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5063  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41 
 
 		 540 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.6439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3913  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.2 
 
 		 545 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4218  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.42 
 
 		 546 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00118244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2019  ubiquinone biosynthesis protein AarF  39.96 
 
 		 542 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03728  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.33 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4144  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.33 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4059  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.33 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4307  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.33 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5276  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.33 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.709941  normal  0.225701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4173  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.33 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00514072 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4356  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.33 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0250  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.21 
 
 		 543 aa  356  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.370587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03677  hypothetical protein  37.33 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45430  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.1 
 
 		 537 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0385  2-octaprenylphenol hydroxylase  43.06 
 
 		 534 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.312761  normal  0.126935 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2998  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.21 
 
 		 543 aa  354  2.9999999999999997e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5152  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  41.39 
 
 		 539 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4245  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.57 
 
 		 546 aa  352  8e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.806176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0387  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.18 
 
 		 539 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4054  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.05 
 
 		 546 aa  351  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3375  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.92 
 
 		 549 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3204  ubiquinone biosynthesis protein AarF  38.99 
 
 		 549 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0971234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4098  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.28 
 
 		 549 aa  350  4e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03488  predicted protein kinase  42.07 
 
 		 529 aa  350  5e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2702  2-octaprenylphenol hydroxylase  39.34 
 
 		 534 aa  349  9e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0525  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.13 
 
 		 549 aa  348  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0544  2-octaprenylphenol hydroxylase  36.75 
 
 		 544 aa  348  2e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3943  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.8 
 
 		 543 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0473  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.39 
 
 		 549 aa  347  4e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0273  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.56 
 
 		 543 aa  347  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3639  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.56 
 
 		 543 aa  347  4e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0504  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.69 
 
 		 549 aa  346  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3761  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  36.74 
 
 		 545 aa  346  8e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001925  ubiquinone biosynthesis monooxygenase UbiB  39.66 
 
 		 544 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00564  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.04 
 
 		 544 aa  345  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2345  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.35 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.391466  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0101  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.05 
 
 		 561 aa  339  7e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2430  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.88 
 
 		 544 aa  339  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4211  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  40.09 
 
 		 544 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.869806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0429  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.83 
 
 		 549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000673337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0417  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.83 
 
 		 549 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.915437  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3897  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.83 
 
 		 549 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0443  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  39.83 
 
 		 549 aa  337  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.627543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0400  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.55 
 
 		 546 aa  336  5.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4201  ubiquinone biosynthesis protein AarF  36.99 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2820  hypothetical protein  38.67 
 
 		 549 aa  335  1e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0213  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.21 
 
 		 522 aa  335  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.331416 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3794  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  38.11 
 
 		 549 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.647257  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3727  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.89 
 
 		 549 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3553  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.43 
 
 		 549 aa  333  4e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.96851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2972  hypothetical protein  35.97 
 
 		 549 aa  333  6e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0403  2-octaprenylphenol hydroxylase  38.43 
 
 		 549 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.977603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0296  ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.81 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.877142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0459  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  37.94 
 
 		 549 aa  331  2e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1098  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.47 
 
 		 552 aa  330  5.0000000000000004e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1190  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.68 
 
 		 552 aa  329  6e-89  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.601295  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0175  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  40.14 
 
 		 551 aa  329  9e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.356136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1186  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  35.28 
 
 		 556 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4010  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  41.5 
 
 		 522 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000133652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0377  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.69 
 
 		 527 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0988  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.3 
 
 		 504 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0374  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.96 
 
 		 525 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.218508 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0434  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.5 
 
 		 525 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0863  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  39.12 
 
 		 517 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0351  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.57 
 
 		 525 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.594267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0336  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.57 
 
 		 525 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0556  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.84 
 
 		 525 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1294  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.46 
 
 		 521 aa  319  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0881794  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0461  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.06 
 
 		 525 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0784  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.11 
 
 		 517 aa  318  2e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4047  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  37.85 
 
 		 525 aa  318  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.690468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0799  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.68 
 
 		 521 aa  318  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0670  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.84 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0189  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.84 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2401  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.84 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0848  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.84 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.120118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2757  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.84 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.925826  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02769  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.99 
 
 		 557 aa  317  4e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368527  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0686  putative ubiquinone biosynthesis protein UbiB  38.84 
 
 		 525 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485963  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>