More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0809 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  99.44 
 
 		 535 aa  1092    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  67.85 
 
 		 533 aa  735    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  67.85 
 
 		 533 aa  734    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  67.42 
 
 		 534 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  99.44 
 
 		 535 aa  1092    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  86.54 
 
 		 535 aa  966    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  100 
 
 		 535 aa  1097    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  31.1 
 
 		 546 aa  257  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  30.74 
 
 		 549 aa  247  4e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  28.49 
 
 		 551 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  27.58 
 
 		 560 aa  211  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  27.97 
 
 		 537 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  26.48 
 
 		 547 aa  177  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  30.73 
 
 		 403 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  25.99 
 
 		 535 aa  175  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  28.38 
 
 		 572 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  28.93 
 
 		 549 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  23.54 
 
 		 546 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  29.3 
 
 		 555 aa  123  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  30.42 
 
 		 540 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  30.23 
 
 		 577 aa  120  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  24.51 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  29.27 
 
 		 449 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  23.23 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  27.62 
 
 		 553 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  21.46 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  24.55 
 
 		 540 aa  103  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  28.05 
 
 		 561 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  21.13 
 
 		 513 aa  93.6  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  32.79 
 
 		 132 aa  80.5  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  27.24 
 
 		 587 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0999  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 132 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 133 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 133 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  30.95 
 
 		 133 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 127 aa  77  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  33.86 
 
 		 134 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  31.71 
 
 		 148 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 129 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 129 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 132 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  31.71 
 
 		 129 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  31.15 
 
 		 131 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 129 aa  75.5  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1379  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 135 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.415787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 129 aa  75.1  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 131 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  74.3  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2279  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0135574  normal  0.58639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  33.88 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  30.33 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  30.33 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  31.15 
 
 		 129 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 129 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3209  chemotaxis protein CheY  31.97 
 
 		 127 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0736  response regulator receiver  29.51 
 
 		 131 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 188 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1360  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.174372  normal  0.090944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2918  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.67374  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1384  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 127 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0134523  normal  0.274763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3050  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.217098 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0324  response regulator receiver protein  31.09 
 
 		 126 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.336165  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2908  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  31.15 
 
 		 129 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1300  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1367  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.769538  normal  0.49981 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 131 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1455  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 123 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.293422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 131 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2558  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 127 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.87788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2852  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 131 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2076  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000896604 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3808  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 131 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 128 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3176  hypothetical protein  31.15 
 
 		 131 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 131 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 131 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3048  response regulator receiver protein  31.15 
 
 		 127 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0702091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1344  response regulator receiver  31.97 
 
 		 127 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.80307  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1690  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 131 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2131  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000184197 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3123  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 131 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.774714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  20.89 
 
 		 539 aa  72.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1200  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 123 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0192421  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  30.58 
 
 		 127 aa  72  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1653  chemotaxis protein CheY  31.4 
 
 		 130 aa  72  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000247542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  31.15 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03143  hypothetical protein  31.4 
 
 		 130 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002833  chemotaxis regulator CheY  31.4 
 
 		 126 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000239201  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>