More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2164 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  53.96 
 
 
684 aa  701    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  58.83 
 
 
704 aa  826    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  53.17 
 
 
690 aa  691    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  52.25 
 
 
686 aa  657    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  53.74 
 
 
679 aa  677    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  63.3 
 
 
682 aa  914    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  50.44 
 
 
680 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  53.3 
 
 
678 aa  705    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  60.82 
 
 
692 aa  859    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  70.19 
 
 
714 aa  1031    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  51.32 
 
 
680 aa  690    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  52.34 
 
 
680 aa  715    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.42 
 
 
682 aa  684    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  60.82 
 
 
686 aa  867    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  60.88 
 
 
802 aa  861    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  50.59 
 
 
738 aa  683    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  51.38 
 
 
687 aa  689    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  62.1 
 
 
685 aa  882    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  54.33 
 
 
679 aa  715    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  62.5 
 
 
716 aa  892    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  53.39 
 
 
699 aa  673    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  50.44 
 
 
680 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  51.85 
 
 
681 aa  678    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  59.12 
 
 
691 aa  823    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  54.34 
 
 
678 aa  723    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  100 
 
 
689 aa  1434    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  52.65 
 
 
690 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  51.03 
 
 
681 aa  676    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  55.07 
 
 
679 aa  729    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  50.44 
 
 
680 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  53 
 
 
680 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  54.51 
 
 
683 aa  718    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  53.46 
 
 
690 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  46.66 
 
 
642 aa  615  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  46.66 
 
 
645 aa  618  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  46.41 
 
 
652 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  45.07 
 
 
647 aa  560  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  42.41 
 
 
635 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  42.11 
 
 
635 aa  551  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  42.92 
 
 
647 aa  518  1.0000000000000001e-145  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  43.66 
 
 
676 aa  511  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  43.93 
 
 
644 aa  507  9.999999999999999e-143  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  57.26 
 
 
846 aa  426  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  32.46 
 
 
650 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  29.46 
 
 
600 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  27.56 
 
 
573 aa  177  7e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  26.35 
 
 
583 aa  176  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.57 
 
 
566 aa  172  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.28 
 
 
566 aa  171  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  28.74 
 
 
587 aa  171  5e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  29.26 
 
 
566 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.47 
 
 
577 aa  169  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  26.83 
 
 
576 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  26.48 
 
 
576 aa  154  5e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  25.27 
 
 
574 aa  152  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  27.74 
 
 
554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  28.14 
 
 
567 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28.89 
 
 
539 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  26.87 
 
 
611 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.88 
 
 
575 aa  146  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  27.05 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  26.36 
 
 
538 aa  140  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  26.28 
 
 
658 aa  140  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  26.32 
 
 
564 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.62 
 
 
543 aa  138  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  26.46 
 
 
599 aa  137  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  27.42 
 
 
548 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  26.53 
 
 
552 aa  135  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3108  NAD+ synthetase  26.24 
 
 
591 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00105483  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  27.05 
 
 
567 aa  135  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.93 
 
 
686 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2601  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.25 
 
 
597 aa  134  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  27.42 
 
 
567 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0908  NAD+ synthetase  26.46 
 
 
571 aa  133  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.31123  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1253  NAD+ synthetase  27.32 
 
 
584 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.0942675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  27.08 
 
 
567 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  24.59 
 
 
540 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  27.49 
 
 
556 aa  130  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  26.3 
 
 
542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  24.74 
 
 
565 aa  128  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  24.11 
 
 
700 aa  128  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  27.47 
 
 
561 aa  127  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2309  NAD+ synthetase  24.48 
 
 
562 aa  127  9e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  25.12 
 
 
541 aa  127  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  26.12 
 
 
542 aa  126  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.15 
 
 
577 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1765  NAD+ synthetase  25.62 
 
 
601 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0678882  hitchhiker  0.000901061 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  26.1 
 
 
598 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0983  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.9 
 
 
577 aa  124  5e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.29742  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  26.07 
 
 
561 aa  123  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.2 
 
 
540 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0982  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  25.97 
 
 
552 aa  123  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0428  glutamine-dependent NAD+ synthetase  26.22 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0925  NAD+ synthetase  26.14 
 
 
590 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  25.96 
 
 
571 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0590  NAD+ synthetase  26.22 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  25.45 
 
 
688 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  25.73 
 
 
545 aa  122  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.86 
 
 
535 aa  122  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1494  NAD+ synthetase  25 
 
 
582 aa  122  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0582262  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>