51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2665 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2665  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  93 
 
 		 100 aa  191  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0209  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  78.43 
 
 		 102 aa  158  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0245  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  63.37 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2666  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  64.36 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.518316  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0303  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  69.07 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0759911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0208  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding domain protein  67.71 
 
 		 164 aa  136  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1950  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  64.21 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.246705 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  62.5 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0322363 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0370  ferredoxin, 4Fe-4S, putative  64.04 
 
 		 108 aa  124  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.426462  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1949  hypothetical protein  60.87 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.573256 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1300  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.04 
 
 		 102 aa  104  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1002  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  51.52 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0150146  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0440  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  45 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1181  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.98 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.77 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000269447  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1006  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.77 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0104746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2219  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  43.84 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000028084  hitchhiker  0.0000143295 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0685  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.07 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0539  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0121  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.19 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.548661  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1935  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.38 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  39.68 
 
 		 502 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0560  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  30.86 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1395  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  30.86 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0639  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  30.86 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1811  ferredoxin  43.75 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.243478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2383  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.03 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0457  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.88 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.304767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1417  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.44 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3312  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.35 
 
 		 368 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.33 
 
 		 652 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.31 
 
 		 392 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000007278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3425  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.57 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.121057  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  37.5 
 
 		 503 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3150  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.88 
 
 		 242 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.568616  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0318  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  31.88 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.188751  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0817  2-oxoglutarate-acceptor oxidoreductase subunit OorD  30.86 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2127  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.46 
 
 		 427 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0848  hydrogenases, Fe-only  35.48 
 
 		 417 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0877  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.21 
 
 		 995 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.38 
 
 		 367 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1371  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 392 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000930886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  34.43 
 
 		 273 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  35.38 
 
 		 455 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0832  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.39 
 
 		 314 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00148758  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.9 
 
 		 378 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0632  ferredoxin III, nif-specific  40.58 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.531149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0197  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.62 
 
 		 491 aa  40  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0114933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>