34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2388 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 106 aa  220  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  76.42 
 
 		 109 aa  169  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  77.78 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  60.95 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  63.89 
 
 		 108 aa  141  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  67.29 
 
 		 126 aa  142  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  66.67 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  38.89 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  43.01 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  39.18 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  37.89 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  36.46 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  39.18 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  35.79 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  35.24 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  32.97 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  37 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  45.9 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 307 aa  51.2  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 309 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  55.1 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  51.02 
 
 		 230 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  52.17 
 
 		 237 aa  47.4  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  47.27 
 
 		 231 aa  47.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  48.08 
 
 		 306 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  46 
 
 		 234 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0496  hypothetical protein  74.07 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0554271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 299 aa  43.9  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  48 
 
 		 299 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>