More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1296 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  100 
 
 
230 aa  480  1e-135  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  67.83 
 
 
230 aa  329  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  65.93 
 
 
236 aa  323  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0495  metallophosphoesterase  56.96 
 
 
231 aa  292  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  58.04 
 
 
235 aa  284  9e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  53.04 
 
 
230 aa  274  8e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  47.96 
 
 
218 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  43.52 
 
 
209 aa  155  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  41.2 
 
 
209 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  38.43 
 
 
215 aa  142  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  39.09 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1247  metallophosphoesterase  41.18 
 
 
208 aa  124  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312472  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  35.06 
 
 
254 aa  115  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  33.19 
 
 
243 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  34.2 
 
 
251 aa  112  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4732  putative serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 
234 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0607  putative serine/threonine phosphatase  32.13 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1588  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  34.22 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.094703  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0597  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.22 
 
 
235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0484  metallophosphoesterase  32.13 
 
 
234 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1580  serine/threonine specific protein phosphatase (protein phosphatase 1)  35.14 
 
 
227 aa  108  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0522604  normal  0.0445956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.34 
 
 
248 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  31.44 
 
 
223 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  32.34 
 
 
248 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  32.48 
 
 
250 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2328  metallophosphoesterase  31.76 
 
 
245 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2197  metallophosphoesterase  34.63 
 
 
233 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0077  metallophosphoesterase  30.51 
 
 
243 aa  105  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2149  metallophosphoesterase  34.63 
 
 
233 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1036  putative serine/threonine protein phosphatase  31.62 
 
 
236 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.4139  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1659  metallophosphoesterase  36.32 
 
 
238 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0884  metallophosphoesterase  30.32 
 
 
244 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0701  putative serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 
234 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3221  metallophosphoesterase  34.83 
 
 
233 aa  102  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0633  serine/threonine phosphatase, putative  30.92 
 
 
234 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0483  serine/threonine protein phosphatase  31.23 
 
 
238 aa  102  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0626  putative serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 
234 aa  101  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0481  serine/threonine protein phosphatase  31.33 
 
 
234 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0678743  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0539  serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 
234 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0570  serine/threonine phosphatase  31.33 
 
 
234 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  33.47 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1902  metallophosphoesterase  33.6 
 
 
268 aa  99.4  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0529367  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  34.56 
 
 
213 aa  99  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03730  serine/threonine protein phosphatase  26.89 
 
 
242 aa  96.3  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.335264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0747  metallophosphoesterase  32.95 
 
 
243 aa  95.5  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.827627  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4822  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.98 
 
 
257 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3780  metallophosphoesterase  32.34 
 
 
251 aa  92.8  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  33.18 
 
 
213 aa  92.4  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3024  metallophosphoesterase  32.5 
 
 
356 aa  92  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3500  metallophosphoesterase  32 
 
 
224 aa  92  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659372 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  29.74 
 
 
291 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  30.51 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  31.2 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3040  metallophosphoesterase  32.47 
 
 
268 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0661  metallophosphoesterase  29.26 
 
 
249 aa  89.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0635365  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
224 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3532  metallophosphoesterase  32.22 
 
 
255 aa  89  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0300439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1488  metallophosphoesterase  32.46 
 
 
266 aa  89  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  33.03 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  35.19 
 
 
221 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  32.88 
 
 
234 aa  89  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4812  metallophosphoesterase  33.76 
 
 
257 aa  88.6  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.709692  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  30.21 
 
 
251 aa  88.6  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  34.42 
 
 
224 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0709  metallophosphoesterase  34.95 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.400864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3775  metallophosphoesterase  30.83 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3090  metallophosphoesterase  28.76 
 
 
220 aa  86.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108769  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  31.06 
 
 
267 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3967  metallophosphoesterase  30.42 
 
 
280 aa  85.1  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0475  metallophosphoesterase  26.89 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0816105  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  30.17 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0370  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3006  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
244 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1582  metallophosphoesterase  30.09 
 
 
265 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000731771  normal  0.190685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3606  metallophosphoesterase  27.85 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4702  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.61 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  30.43 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1327  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.27 
 
 
240 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4095  metallophosphoesterase  30.4 
 
 
334 aa  78.6  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590494  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3022  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.39 
 
 
244 aa  78.2  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.174708  normal  0.43626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1134  metallophosphoesterase  31.03 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.924043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3109  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.304635 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0021  metallophosphoesterase  27.71 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  26.21 
 
 
850 aa  75.5  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3367  metallophosphoesterase  31.11 
 
 
245 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0260954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1353  hypothetical protein  28.11 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43482  predicted protein  27.43 
 
 
1225 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1654  serine/threonine specific protein phosphatase  28.89 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0069459  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3319  metallophosphoesterase  29.74 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3546  serine/threonine protein phosphatase I  29.13 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  27.8 
 
 
847 aa  72.8  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2179  metallophosphoesterase  28.51 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  27.6 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0206  diadenosine tetraphosphatase  26.35 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B1  diadenosine tetraphosphatase-like protein  27.39 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3236  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  25.62 
 
 
260 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3390  metallophosphoesterase  44.79 
 
 
253 aa  68.9  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1664  metallophosphoesterase  26.36 
 
 
269 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0848196 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  27.6 
 
 
870 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  28.45 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>