150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1252 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1252  Methylglyoxal synthase-like protein  100 
 
 		 328 aa  687    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2651  methylglyoxal synthase  42.62 
 
 		 140 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.957792  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2192  methylglyoxal synthase  40.32 
 
 		 122 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0985  methylglyoxal synthase  36.03 
 
 		 135 aa  86.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1982  methylglyoxal synthase  45.63 
 
 		 143 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0061  hypothetical protein  43.8 
 
 		 288 aa  85.9  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2382  methylglyoxal synthase  45.63 
 
 		 146 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2291  methylglyoxal synthase  40 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2314  methylglyoxal synthase  40 
 
 		 130 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.659726 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1309  methylglyoxal synthase  39.06 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.871383  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3178  methylglyoxal synthase  46.08 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1679  methylglyoxal synthase  40 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0255708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0792  methylglyoxal synthase  46.6 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52468  normal  0.131121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1333  methylglyoxal synthase  41.94 
 
 		 125 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.714194  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0194  methylglyoxal synthase  41.07 
 
 		 122 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0967  methylglyoxal synthase  41.18 
 
 		 123 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5618  methylglyoxal synthase  39.23 
 
 		 130 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0573538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1018  methylglyoxal synthase  41.67 
 
 		 130 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.736302  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1302  methylglyoxal synthase  43.69 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000113114  decreased coverage  0.00562878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00533  methylglyoxal synthase  37.93 
 
 		 136 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0987  methylglyoxal synthase  40 
 
 		 130 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2185  methylglyoxal synthase  44.14 
 
 		 135 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0445857  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1881  methylglyoxal synthase  41.67 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1390  methylglyoxal synthase  41.67 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2123  methylglyoxal synthase  44.76 
 
 		 140 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.336211  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1079  methylglyoxal synthase  41.67 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.233114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0788  methylglyoxal synthase  41.67 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0615906  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1235  methylglyoxal synthase  41.67 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1244  methylglyoxal synthase  41.67 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.473905  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0362  methylglyoxal synthase  41.67 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.607553  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2329  methylglyoxal synthase  39.23 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1706  methylglyoxal synthase  45.1 
 
 		 130 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1077  methylglyoxal synthase  32.47 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.330764  hitchhiker  0.000000505204 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1257  methylglyoxal synthase  42.19 
 
 		 131 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2207  methylglyoxal synthase  39.23 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.093882  normal  0.861141 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2061  methylglyoxal synthase  44.66 
 
 		 129 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337955  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1443  methylglyoxal synthase  40.62 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0250107  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1556  methylglyoxal synthase  40.62 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1662  methylglyoxal synthase  40.62 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1415  methylglyoxal synthase  40.62 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0291451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1416  methylglyoxal synthase  40.62 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032143  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1700  methylglyoxal synthase  40.62 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1627  methylglyoxal synthase  40.62 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.15767 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3756  methylglyoxal synthase  40.62 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4588  methylglyoxal synthase  40.83 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1589  methylglyoxal synthase  40.62 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1304  methylglyoxal synthase  44.66 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206043  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1459  methylglyoxal synthase  39.84 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0146321  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1275  methylglyoxal synthase  43.81 
 
 		 128 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.418994  hitchhiker  0.00000238684 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0366  methylglyoxal synthase  38.26 
 
 		 126 aa  78.6  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0594  methylglyoxal synthase  37.93 
 
 		 128 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.444681  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1048  methylglyoxal synthase  41.41 
 
 		 125 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.171658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3256  methylglyoxal synthase  44.66 
 
 		 129 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.308691  normal  0.881072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3595  methylglyoxal synthase  38.84 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1265  methylglyoxal synthase  40.65 
 
 		 119 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.357495  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1077  methylglyoxal synthase  39.84 
 
 		 119 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_145  methylglyoxal synthase  37.96 
 
 		 144 aa  78.2  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0986  methylglyoxal synthase  41.41 
 
 		 125 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0240  methylglyoxal synthase  42.2 
 
 		 126 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.822912  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1798  methylglyoxal synthase  40.54 
 
 		 123 aa  78.2  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.061495  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2517  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  37.98 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.955046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04890  Dephospho-CoA kinase  41.75 
 
 		 317 aa  77  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0496  methylglyoxal synthase  39.68 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0861  methylglyoxal synthase  38.32 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2504  methylglyoxal synthase  43.69 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1906  methylglyoxal synthase  39 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2805  methylglyoxal synthase  37.3 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.321447  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0233  methylglyoxal synthase  37.04 
 
 		 144 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2072  methylglyoxal synthase  37.01 
 
 		 126 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246305  normal  0.326665 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1587  methylglyoxal synthase-like protein  32.89 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0187012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0707  methylglyoxal synthase  40.19 
 
 		 120 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1248  methylglyoxal synthase  36.45 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.10803  normal  0.0156923 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3603  cyclic nucleotide-binding protein  39.17 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.181046  normal  0.223623 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1568  methylglyoxal synthase  35.88 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1634  methylglyoxal synthase  35.88 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4019  hypothetical protein  35.29 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1097  methylglyoxal synthase  35.92 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2484  methylglyoxal synthase  38.94 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0918  methylglyoxal synthase  35.92 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.502742  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4444  methylglyoxal synthase  41.9 
 
 		 126 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2068  methylglyoxal synthase  34.81 
 
 		 155 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0241  methylglyoxal synthase  38.33 
 
 		 137 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3368  methylglyoxal synthase  36.29 
 
 		 126 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3100  methylglyoxal synthase  35.83 
 
 		 159 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000537533  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0137  methylglyoxal synthase  35.19 
 
 		 144 aa  71.6  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4130  methylglyoxal synthase  41.9 
 
 		 126 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.070186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0703  methylglyoxal synthase  34.88 
 
 		 151 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000171943 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0042  methylglyoxal synthase  39.34 
 
 		 127 aa  70.9  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2126  methylglyoxal synthase  40 
 
 		 132 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000882281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2082  methylglyoxal synthase  32.79 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5146  hypothetical protein  39.45 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.886963  normal  0.124593 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0611  methylglyoxal synthase  37.27 
 
 		 155 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0524  methylglyoxal synthase  36.19 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2381  methylglyoxal synthase  40.78 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0265896  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2625  methylglyoxal synthase  35.92 
 
 		 158 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2894  methylglyoxal synthase  33.33 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0227656 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1163  methylglyoxal synthase  35.25 
 
 		 128 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.618904  normal  0.0141735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21210  methylglyoxal synthase  33.08 
 
 		 148 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846941  normal  0.0527752 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1240  methylglyoxal synthase  34.95 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2719  methylglyoxal synthase  34.95 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>