92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1672 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1672  putative ferredoxin 2fe-2s protein  100 
 
 		 38 aa  79  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1965  putative ferredoxin 2fe-2s protein  84.21 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0185  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  71.43 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.808943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0191  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  68.57 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.392497 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0227  ferredoxin-like protein  56.76 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0329  putative ferredoxin 2FE-2S protein  65.71 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0383  ferredoxin-like protein  61.11 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2790  ferredoxin, 2Fe-2S  63.89 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000127071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0278  putative ferredoxin  60 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2553  ferredoxin-like protein  56.76 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218223  normal  0.835229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3881  Fe2-S2-type ferredoxin  62.16 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4158  Fe2-S2-type ferredoxin  64.86 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2332  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  65.71 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0330  ferredoxin-like protein  61.76 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0352386 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2243  ferredoxin, 2Fe-2S  58.33 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.600015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4220  putative ferredoxin  54.05 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0496  putative ferredoxin  56.76 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697276  normal  0.0196936 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0279  putative ferredoxin 2fe-2s protein  56.76 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.444839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2839  ferredoxin, putative  58.33 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00156356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3238  ferredoxin, putative  58.33 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0134  ferredoxin-like  54.29 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0408  ferredoxin-like protein  56.76 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.920183  normal  0.0133619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4923  ferredoxin-like protein  55.56 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00479937  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0210  putative ferredoxin  60 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3574  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  62.86 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0548526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0978  putative ferredoxin 2fe-2s protein  56.76 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.76385  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0341  NADH dehydrogenase (quinone)  57.14 
 
 		 597 aa  51.2  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.024737  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0566  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  64.71 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0195  ferredoxin-like protein  52.94 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00894898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6238  ferredoxin-like  54.05 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2905  ferredoxin-like protein  54.05 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2807  ferredoxin-like protein  54.05 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.46384 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2896  ferredoxin-like protein  54.05 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0123566  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2945  ferredoxin-like protein  54.05 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1686  NADH dehydrogenase (quinone)  51.35 
 
 		 545 aa  50.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0377  ferredoxin-like protein  50 
 
 		 119 aa  50.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.421003  normal  0.297755 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1043  Fe2-S2-type ferredoxin  54.05 
 
 		 104 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0741515  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2281  ferredoxin-like  54.05 
 
 		 105 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2650  putative ferredoxin  54.05 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.342281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2308  putative ferredoxin 2fe-2s protein  58.33 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0610849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2744  putative ferredoxin  54.05 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0673585  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1216  putative ferredoxin  54.05 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.0000529372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4235  ferredoxin-like protein  52.78 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.319117 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1366  ferredoxin, 2Fe-2S  54.05 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0617  ferredoxin, 2Fe-2S  54.05 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.497669  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0378  ferredoxin, 2Fe-2S  54.05 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0061  ferredoxin, 2Fe-2S  54.05 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0227  ferredoxin, 2Fe-2S  54.05 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636901  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0309  putative ferredoxin  58.33 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000885612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0436  ferredoxin, putative  54.05 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.547731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0455  ferredoxin family protein  54.05 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268265  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3196  ferredoxin, 2Fe-2S  54.05 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1394  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  62.86 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3802  ferredoxin-like  54.29 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000235689  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0248  ferredoxin-like  52.94 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000208905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1060  cob(I)alamin adenosyltransferase  62.5 
 
 		 343 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4000  ferredoxin-like protein  51.35 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000000776711 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0213  putative ferredoxin 2Fe-2S protein  55.26 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.348097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5882  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  57.14 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141586  normal  0.60259 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0265  ferredoxin-like protein  58.82 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00274721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0270  ferredoxin-like protein  58.82 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.333307  hitchhiker  0.00000159951 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13331  ferredoxin  47.06 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1240  hypothetical protein  47.06 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.264349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0256  ferredoxin, 2Fe-2S  54.29 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2233  Respiratory-chain NADH dehydrogenase domain 51 kDa subunit  51.43 
 
 		 597 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3804  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 595 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1738  ferredoxin, 2Fe-2S (AaFd4)  54.29 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.600771 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2763  hypothetical protein  54.05 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13181  ferredoxin  44.12 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.034163  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  51.43 
 
 		 597 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0047  ferredoxin, 2Fe-2S  51.35 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000617447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03740  putative ferredoxin protein  54.55 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0703  ferredoxin 2fe-2s  59.38 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000267477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1475  ferredoxin, 2Fe-2s  59.38 
 
 		 132 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1338  NADH dehydrogenase (quinone)  51.43 
 
 		 572 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2636  hypothetical protein  51.35 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0898  ferredoxin like protein  48.57 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.216667  hitchhiker  0.00626821 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3654  putative ferredoxin  44.44 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0180511 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0705  ferrodoxin  47.37 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2621  putative ferredoxin  50 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0486  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00104952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2317  ferredoxin, 2Fe-2S  54.29 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00345653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2139  NADH dehydrogenase (quinone)  44.12 
 
 		 596 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08641  ferredoxin  39.39 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0451  hypothetical protein  42.86 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.419137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1298  NADH dehydrogenase (quinone)  45.71 
 
 		 598 aa  41.6  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1149  ferredoxin, 2Fe-2S  48.57 
 
 		 102 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.206142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3087  ferredoxin-like protein  56.25 
 
 		 114 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389832 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0078  hypothetical protein  45.71 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0919  NADH dehydrogenase (quinone)  42.86 
 
 		 596 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1652  NADH dehydrogenase (quinone)  45.71 
 
 		 569 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0208295  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2152  hypothetical protein  45.71 
 
 		 116 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.049564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>