More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4525 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  524  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1025  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.22 
 
 
253 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5048  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.43 
 
 
253 aa  347  8e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.986689  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.49 
 
 
258 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  normal  0.315774 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1698  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.68 
 
 
253 aa  329  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.891698  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2916  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.85 
 
 
252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1065  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.89 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0982  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.89 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1403  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.89 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0520  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.89 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.62164  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.96 
 
 
267 aa  327  2.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2297  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.89 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.85 
 
 
252 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.614437  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1486  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.89 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0128  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.89 
 
 
253 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.68 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1999  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.33 
 
 
268 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0201  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.87 
 
 
261 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19793  normal  0.222438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.08 
 
 
257 aa  315  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0866  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.14 
 
 
262 aa  315  6e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6100  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.2 
 
 
254 aa  310  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2975  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58 
 
 
257 aa  306  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.065434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.97 
 
 
269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0762  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.57 
 
 
255 aa  302  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2694  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.45 
 
 
252 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3497  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.71 
 
 
266 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.393311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4869  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.71 
 
 
266 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5417  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.71 
 
 
266 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.8 
 
 
260 aa  298  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0184515  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.6 
 
 
273 aa  294  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2379  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.52 
 
 
258 aa  294  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.272074  hitchhiker  0.0000354312 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0050  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.76 
 
 
257 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0341246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6912  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.6 
 
 
260 aa  291  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0355  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.58 
 
 
257 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654487  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 
259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2653  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  54 
 
 
275 aa  281  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3687  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.59 
 
 
259 aa  280  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101033  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.6 
 
 
259 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3029  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  57.2 
 
 
258 aa  275  6e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.6 
 
 
260 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5744  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.62 
 
 
259 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
258 aa  267  1e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0628  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.4 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
259 aa  261  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280067  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49 
 
 
261 aa  257  1e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.8 
 
 
264 aa  255  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.4 
 
 
282 aa  255  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0978  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
261 aa  255  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
279 aa  254  7e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.8 
 
 
268 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0741  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.61 
 
 
272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.8 
 
 
268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  50.2 
 
 
254 aa  252  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51 
 
 
262 aa  251  8.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.59 
 
 
268 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  47.98 
 
 
255 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  51.59 
 
 
286 aa  249  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.4 
 
 
272 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2171  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49 
 
 
272 aa  249  4e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2083  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49 
 
 
272 aa  249  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.464026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.6 
 
 
282 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49 
 
 
272 aa  248  7e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.21 
 
 
273 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.61 
 
 
279 aa  248  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
282 aa  247  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  49.21 
 
 
279 aa  247  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  51.59 
 
 
286 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.19 
 
 
268 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.2 
 
 
282 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.8 
 
 
282 aa  246  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111733  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.61 
 
 
272 aa  247  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.81 
 
 
272 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 
258 aa  245  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49 
 
 
273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  50.2 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.21 
 
 
272 aa  244  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.61 
 
 
272 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
254 aa  244  8e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.117413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.61 
 
 
272 aa  244  9e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.01 
 
 
292 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2476  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.61 
 
 
270 aa  242  3e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0264852  normal  0.0112643 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  45.02 
 
 
280 aa  241  7.999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3279  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.61 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0611  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.42 
 
 
281 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
262 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
284 aa  240  1e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.190208 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1790  NADH dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  48.21 
 
 
272 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00952782  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.81 
 
 
272 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.82 
 
 
266 aa  240  2e-62  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.62 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0396  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.6 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.632907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.43 
 
 
254 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.25 
 
 
254 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.43 
 
 
272 aa  239  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0180  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  46.64 
 
 
264 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26134  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2024  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.7 
 
 
258 aa  239  4e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0517345 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1181  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.43 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2057  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.66 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.6 
 
 
261 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0222  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.82 
 
 
281 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>