More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3226 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  100 
 
 
257 aa  526  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5048  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.19 
 
 
253 aa  363  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.986689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1025  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.19 
 
 
253 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0128  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.61 
 
 
253 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1403  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.61 
 
 
253 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1486  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.61 
 
 
253 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2297  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.61 
 
 
253 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0520  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.61 
 
 
253 aa  358  6e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.62164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0982  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.61 
 
 
253 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1065  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.61 
 
 
253 aa  358  6e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1698  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.14 
 
 
253 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.891698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.27 
 
 
258 aa  352  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  normal  0.315774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.56 
 
 
267 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1999  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.87 
 
 
268 aa  332  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0201  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.64 
 
 
261 aa  330  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19793  normal  0.222438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0866  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.35 
 
 
262 aa  330  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.08 
 
 
254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.26 
 
 
256 aa  325  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.44 
 
 
252 aa  321  6e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.614437  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0050  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.75 
 
 
257 aa  321  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0341246 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2916  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.44 
 
 
252 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.36 
 
 
273 aa  316  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6912  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.56 
 
 
260 aa  315  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6100  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.68 
 
 
254 aa  315  4e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.76 
 
 
260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0184515  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2694  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.64 
 
 
252 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0355  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.08 
 
 
257 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654487  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2975  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58 
 
 
257 aa  308  8e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.065434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.57 
 
 
269 aa  305  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3687  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.76 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101033  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3497  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.5 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.393311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4869  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.5 
 
 
266 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2379  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  58.14 
 
 
258 aa  302  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.272074  hitchhiker  0.0000354312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3029  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  62 
 
 
258 aa  300  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5417  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.1 
 
 
266 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.2 
 
 
260 aa  295  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2653  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  55.6 
 
 
275 aa  291  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5744  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.25 
 
 
259 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0762  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.38 
 
 
255 aa  287  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.25 
 
 
258 aa  287  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.18 
 
 
259 aa  286  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 
259 aa  281  8.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0628  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.4 
 
 
259 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0978  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
261 aa  269  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.36 
 
 
259 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  48.21 
 
 
254 aa  244  8e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.61 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.41 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  50 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.62 
 
 
256 aa  241  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.61 
 
 
273 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
262 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.08 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.81 
 
 
275 aa  238  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1585  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  45.42 
 
 
260 aa  238  5.999999999999999e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000090122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  44.4 
 
 
255 aa  238  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.31 
 
 
261 aa  237  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  48.02 
 
 
286 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1181  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
258 aa  236  3e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242928  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.82 
 
 
266 aa  236  3e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.62 
 
 
272 aa  235  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
256 aa  235  6e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.6 
 
 
261 aa  234  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.58 
 
 
268 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.82 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0307  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  45.02 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00919457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0857  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.61 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  46.4 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  43.82 
 
 
280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.22 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1245  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.61 
 
 
273 aa  232  5e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.766036  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.22 
 
 
272 aa  232  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2558  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  45.24 
 
 
256 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.646059  hitchhiker  0.0000154465 
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.43 
 
 
272 aa  230  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.82 
 
 
272 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.82 
 
 
274 aa  230  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4292  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.22 
 
 
275 aa  231  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4661  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.22 
 
 
275 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.2 
 
 
282 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111733  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  46 
 
 
259 aa  230  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.6 
 
 
282 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2468  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.61 
 
 
277 aa  229  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.82 
 
 
272 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.78 
 
 
268 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  46.83 
 
 
274 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
282 aa  229  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  44.22 
 
 
255 aa  229  3e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.43 
 
 
272 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.03 
 
 
272 aa  229  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4810  enoyl-acyl carrier protein reductase  46.83 
 
 
275 aa  229  3e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.368185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  41.83 
 
 
272 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1426  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.42 
 
 
274 aa  228  7e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44 
 
 
282 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  42.63 
 
 
272 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.22 
 
 
268 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0396  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.82 
 
 
272 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.632907  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.78 
 
 
268 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1587  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.22 
 
 
274 aa  227  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0818628  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  41.83 
 
 
272 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>