More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2709 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
258 aa  526  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3687  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.12 
 
 
259 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101033  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5744  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.63 
 
 
259 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.52 
 
 
260 aa  364  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0628  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.33 
 
 
259 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  71.14 
 
 
259 aa  360  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6912  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.6 
 
 
260 aa  345  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.42 
 
 
260 aa  344  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0184515  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.8 
 
 
273 aa  342  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0201  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.7 
 
 
261 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19793  normal  0.222438 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.75 
 
 
256 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.77 
 
 
267 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0866  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.94 
 
 
262 aa  300  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.77 
 
 
258 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  normal  0.315774 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.4 
 
 
269 aa  294  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2975  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.25 
 
 
257 aa  294  9e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.065434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1025  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.14 
 
 
253 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
259 aa  291  9e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5048  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.8 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.986689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1999  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.6 
 
 
268 aa  288  9e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5417  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.54 
 
 
266 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3497  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.54 
 
 
266 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.393311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4869  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.54 
 
 
266 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.4 
 
 
252 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.614437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2916  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.4 
 
 
252 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0982  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54 
 
 
253 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1403  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54 
 
 
253 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2297  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54 
 
 
253 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1486  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54 
 
 
253 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0520  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54 
 
 
253 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.62164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1065  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54 
 
 
253 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0128  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54 
 
 
253 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.25 
 
 
257 aa  278  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0762  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.97 
 
 
255 aa  277  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1698  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.6 
 
 
253 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.891698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2379  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.25 
 
 
258 aa  271  5.000000000000001e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.272074  hitchhiker  0.0000354312 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2694  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.6 
 
 
252 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0355  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.01 
 
 
257 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654487  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6100  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.98 
 
 
254 aa  267  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
254 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2653  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  51.81 
 
 
275 aa  267  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0050  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.2 
 
 
257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0341246 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0978  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.59 
 
 
261 aa  261  1e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3029  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  55.64 
 
 
258 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  45.24 
 
 
254 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1181  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.39 
 
 
258 aa  231  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
256 aa  222  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0307  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  45.63 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00919457  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.75 
 
 
261 aa  221  6e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.36 
 
 
273 aa  221  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.486877  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.22 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.31 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.615607 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
254 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.117413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.72 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  43.03 
 
 
255 aa  219  3e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1769  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
259 aa  218  6e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311403  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.34 
 
 
272 aa  218  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.32 
 
 
272 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  44.53 
 
 
255 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2130  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.01 
 
 
260 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81879  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 
257 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.97 
 
 
272 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.4 
 
 
268 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
258 aa  217  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.14 
 
 
282 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1585  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  41.67 
 
 
260 aa  216  4e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000090122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.62 
 
 
273 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.05 
 
 
272 aa  215  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.82 
 
 
272 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
282 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.43 
 
 
272 aa  215  7e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3284  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.92 
 
 
264 aa  215  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2558  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  45.63 
 
 
256 aa  215  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.646059  hitchhiker  0.0000154465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.19 
 
 
272 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.63 
 
 
256 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.02 
 
 
282 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.03 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.82 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274334  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.65 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.43 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1821  hypothetical protein  43.97 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1820  hypothetical protein  43.97 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.03 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.03 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1245  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.05 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.766036  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  45.24 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.6 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.22 
 
 
268 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.86 
 
 
261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4281  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.49 
 
 
258 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.905572 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.27 
 
 
254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0180  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  44.66 
 
 
264 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26134  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 
262 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.84 
 
 
261 aa  211  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  42.46 
 
 
274 aa  211  9e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  42.41 
 
 
292 aa  210  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  45.82 
 
 
275 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  42.06 
 
 
274 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>