More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0866 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_0866  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0201  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.7 
 
 
261 aa  352  4e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19793  normal  0.222438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5048  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.4 
 
 
253 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.986689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1025  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.49 
 
 
253 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.8 
 
 
256 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.8 
 
 
258 aa  330  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  normal  0.315774 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.31 
 
 
267 aa  330  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1698  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.2 
 
 
253 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.891698  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.35 
 
 
257 aa  323  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0520  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.4 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.62164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1065  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.4 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1486  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.4 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1403  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.4 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0128  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.4 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2297  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.4 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0982  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.4 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2379  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  59.76 
 
 
258 aa  319  3e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.272074  hitchhiker  0.0000354312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.85 
 
 
273 aa  317  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
254 aa  315  7e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.23 
 
 
252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.614437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2916  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.23 
 
 
252 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1999  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.8 
 
 
268 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6912  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.31 
 
 
260 aa  309  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.17 
 
 
259 aa  308  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.8 
 
 
269 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.59 
 
 
260 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0184515  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2694  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.04 
 
 
252 aa  301  7.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2975  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.6 
 
 
257 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.065434 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.94 
 
 
258 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0628  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.8 
 
 
259 aa  300  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.4 
 
 
260 aa  299  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6100  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.2 
 
 
254 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.4 
 
 
259 aa  295  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3497  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.94 
 
 
266 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.393311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4869  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.94 
 
 
266 aa  294  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5744  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.13 
 
 
259 aa  293  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5417  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.94 
 
 
266 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3687  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.59 
 
 
259 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101033  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2653  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  53.12 
 
 
275 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0050  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
257 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0341246 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0355  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.54 
 
 
257 aa  290  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654487  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0762  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.37 
 
 
255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3029  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  57.94 
 
 
258 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0978  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52 
 
 
261 aa  274  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.8 
 
 
266 aa  256  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  48.4 
 
 
280 aa  255  4e-67  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.97 
 
 
259 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  48.4 
 
 
254 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.2 
 
 
282 aa  251  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.2 
 
 
261 aa  251  1e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
272 aa  251  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.8 
 
 
272 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  51.2 
 
 
275 aa  250  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.6 
 
 
272 aa  249  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1181  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
258 aa  249  2e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.8 
 
 
272 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  49.8 
 
 
286 aa  249  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48 
 
 
279 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
262 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.4 
 
 
272 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.4 
 
 
272 aa  249  4e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.1 
 
 
279 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.6 
 
 
272 aa  247  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
254 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48 
 
 
273 aa  246  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0741  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.8 
 
 
272 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  48.02 
 
 
259 aa  246  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.4 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
262 aa  245  6e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2171  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.8 
 
 
272 aa  244  6.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0550079  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.8 
 
 
261 aa  244  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2083  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.8 
 
 
272 aa  244  6.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.464026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  47.6 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.75394  hitchhiker  0.000398592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  46.9 
 
 
279 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.6 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.8 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.81 
 
 
286 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.2 
 
 
292 aa  243  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
254 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.117413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.39 
 
 
268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.79 
 
 
268 aa  243  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0857  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.8 
 
 
275 aa  243  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.21 
 
 
256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.62 
 
 
260 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00175995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  47.6 
 
 
259 aa  242  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.59 
 
 
268 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.6 
 
 
272 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.6 
 
 
282 aa  240  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.41 
 
 
274 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.4 
 
 
261 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.21 
 
 
262 aa  239  4e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.929436  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.18 
 
 
264 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.8 
 
 
272 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  46.03 
 
 
263 aa  238  8e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2558  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  47.01 
 
 
256 aa  237  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.646059  hitchhiker  0.0000154465 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0611  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.62 
 
 
281 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>