More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0978 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0978  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  100 
 
 
261 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.21 
 
 
267 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.75 
 
 
256 aa  298  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5048  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.2 
 
 
253 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.986689  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2975  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.78 
 
 
257 aa  288  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.065434 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.18 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0201  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.8 
 
 
261 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19793  normal  0.222438 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.6 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  normal  0.315774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2653  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  54.98 
 
 
275 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1025  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.57 
 
 
253 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.79 
 
 
269 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5744  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.92 
 
 
259 aa  275  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0866  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52 
 
 
262 aa  274  9e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3687  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.2 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101033  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6912  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.19 
 
 
260 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.21 
 
 
252 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.614437  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2916  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.21 
 
 
252 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1403  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0982  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1486  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2297  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1065  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0520  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.62164  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0128  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.19 
 
 
260 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0184515  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1698  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50 
 
 
253 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.891698  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.36 
 
 
259 aa  265  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1999  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.16 
 
 
268 aa  264  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.8 
 
 
260 aa  264  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0762  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.79 
 
 
255 aa  261  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
257 aa  261  8e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.59 
 
 
258 aa  261  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2694  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.81 
 
 
252 aa  259  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.81 
 
 
259 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5417  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.2 
 
 
266 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0050  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.8 
 
 
257 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0341246 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  50.6 
 
 
259 aa  257  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6100  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.2 
 
 
254 aa  256  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0628  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.81 
 
 
259 aa  255  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
254 aa  255  5e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3497  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.8 
 
 
266 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.393311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4869  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.8 
 
 
266 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2379  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  50.79 
 
 
258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.272074  hitchhiker  0.0000354312 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  49.6 
 
 
275 aa  251  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0355  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.2 
 
 
257 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654487  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  48.61 
 
 
259 aa  248  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  48.61 
 
 
286 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4810  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.81 
 
 
275 aa  247  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.368185 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.79 
 
 
259 aa  246  3e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4661  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.41 
 
 
275 aa  246  3e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4292  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.41 
 
 
275 aa  246  3e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.8 
 
 
272 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.8 
 
 
272 aa  245  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  48.61 
 
 
286 aa  245  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.31 
 
 
282 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.81 
 
 
274 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.6 
 
 
272 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.6 
 
 
282 aa  242  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.2 
 
 
279 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.61 
 
 
282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.4 
 
 
273 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3029  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  50.2 
 
 
258 aa  239  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.01 
 
 
282 aa  238  5.999999999999999e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.6 
 
 
273 aa  238  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.2 
 
 
272 aa  236  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.53 
 
 
272 aa  236  3e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.53 
 
 
272 aa  234  8e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.8 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.14 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  44.8 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.4 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
265 aa  233  3e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  43.6 
 
 
280 aa  233  3e-60  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1019  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.2 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350664  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2344  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.2 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.187833  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44 
 
 
261 aa  232  6e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44 
 
 
266 aa  231  7.000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.2 
 
 
272 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.2 
 
 
279 aa  231  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  47.01 
 
 
279 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.02 
 
 
257 aa  230  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0420  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.02 
 
 
257 aa  230  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.629326  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.4 
 
 
272 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44 
 
 
292 aa  229  3e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.22 
 
 
268 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2468  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.6 
 
 
277 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3279  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.62 
 
 
256 aa  228  6e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.43 
 
 
268 aa  228  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 
273 aa  227  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1181  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.83 
 
 
258 aa  227  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242928  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0307  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  43.95 
 
 
254 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00919457  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1585  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  43.65 
 
 
260 aa  226  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000090122  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1790  NADH dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.8 
 
 
272 aa  226  3e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00952782  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
262 aa  226  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.2 
 
 
254 aa  224  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0431  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.8 
 
 
269 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.4 
 
 
272 aa  224  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  47.01 
 
 
256 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.03 
 
 
268 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>