More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2795 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_2795  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
259 aa  532  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000141145 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0201  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.6 
 
 
261 aa  308  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19793  normal  0.222438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0866  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.17 
 
 
262 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.36 
 
 
259 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0628  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.96 
 
 
259 aa  298  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
258 aa  291  9e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.869367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.6 
 
 
267 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1565  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.14 
 
 
260 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0184515  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.6 
 
 
254 aa  288  5.0000000000000004e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5744  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.97 
 
 
259 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.540039  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.828259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.97 
 
 
256 aa  285  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.5 
 
 
260 aa  283  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1025  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.6 
 
 
253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3687  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.6 
 
 
259 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101033  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6912  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.6 
 
 
260 aa  281  6.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.91 
 
 
258 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.708426  normal  0.315774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5048  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.8 
 
 
253 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.986689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1999  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.22 
 
 
268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1698  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54 
 
 
253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.891698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6100  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.05 
 
 
254 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1403  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.221595  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2297  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1486  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0520  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.62164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0982  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0128  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.38947  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1065  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.8 
 
 
253 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.6 
 
 
257 aa  267  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2975  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.6 
 
 
257 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.065434 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1256  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.22 
 
 
252 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.614437  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.57 
 
 
269 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.575987  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2916  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.22 
 
 
252 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2379  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  55.02 
 
 
258 aa  265  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.272074  hitchhiker  0.0000354312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2653  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  54.8 
 
 
275 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0050  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52 
 
 
257 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0341246 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2694  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.22 
 
 
252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0762  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.38 
 
 
255 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3497  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.23 
 
 
266 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.393311  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4869  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.23 
 
 
266 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5417  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.23 
 
 
266 aa  248  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0355  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.41 
 
 
257 aa  248  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.654487  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0978  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  50.79 
 
 
261 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3029  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  55.2 
 
 
258 aa  236  3e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1126  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.83 
 
 
256 aa  229  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0465054  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1139  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.43 
 
 
256 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000599586  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1119  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.43 
 
 
256 aa  229  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1113  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.43 
 
 
256 aa  229  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000710304  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1377  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.43 
 
 
256 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0829066  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1272  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.43 
 
 
256 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00654977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1232  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.43 
 
 
256 aa  229  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1300  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.43 
 
 
256 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000387005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1339  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.43 
 
 
256 aa  228  7e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.643434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4070  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  46.43 
 
 
256 aa  228  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.100281  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0920  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.14 
 
 
258 aa  226  3e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000398109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  48.37 
 
 
255 aa  225  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0780  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.27 
 
 
258 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  43.87 
 
 
255 aa  221  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3284  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.33 
 
 
264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.66 
 
 
258 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3279  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.71 
 
 
256 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  48.21 
 
 
286 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.61 
 
 
256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  46.22 
 
 
279 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0180  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  45.63 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26134  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  44.4 
 
 
254 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  47.41 
 
 
286 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44 
 
 
268 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1181  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.16 
 
 
258 aa  209  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242928  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.82 
 
 
263 aa  208  7e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
262 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.4 
 
 
254 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.117413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3169  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  44 
 
 
252 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.315969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1657  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  44.22 
 
 
262 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
261 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.4 
 
 
272 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  46.22 
 
 
259 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.6 
 
 
261 aa  206  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.13 
 
 
265 aa  206  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
258 aa  206  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  45.82 
 
 
259 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.61 
 
 
282 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.6 
 
 
279 aa  205  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.62 
 
 
282 aa  205  8e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1713  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44 
 
 
263 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0298485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  46.22 
 
 
256 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1821  hypothetical protein  43.6 
 
 
268 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1820  hypothetical protein  43.6 
 
 
268 aa  203  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  45.82 
 
 
282 aa  204  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  44.76 
 
 
263 aa  203  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1674  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.63 
 
 
259 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.280067  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  43.94 
 
 
279 aa  201  9e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.95 
 
 
272 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2024  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.19 
 
 
258 aa  201  9e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0517345 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.78 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  43.82 
 
 
282 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
254 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44 
 
 
273 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  44.18 
 
 
268 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>