More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0180 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_0180  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  100 
 
 
264 aa  541  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26134  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1657  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  78.03 
 
 
262 aa  422  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.38 
 
 
262 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  80.3 
 
 
262 aa  412  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3934  hypothetical protein  75 
 
 
262 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0146062  normal  0.728571 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3176  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  75.38 
 
 
262 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.38 
 
 
262 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.445364  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.62 
 
 
288 aa  322  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.75394  hitchhiker  0.000398592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0051  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  58.02 
 
 
267 aa  319  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.18 
 
 
264 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.69 
 
 
291 aa  318  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.185416  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.09 
 
 
268 aa  318  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.69 
 
 
276 aa  318  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0868707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.31 
 
 
277 aa  317  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.917513  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.47 
 
 
268 aa  317  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.85 
 
 
268 aa  314  9e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60 
 
 
268 aa  313  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.06 
 
 
282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.85 
 
 
284 aa  312  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.190208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.65 
 
 
276 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2344  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.59 
 
 
274 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.187833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1019  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.59 
 
 
274 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350664  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.2 
 
 
274 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0611  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.44 
 
 
281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.4 
 
 
275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0741  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.98 
 
 
272 aa  308  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2171  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.74 
 
 
272 aa  308  5e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0550079  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2083  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.74 
 
 
272 aa  308  5e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.464026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4769  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  57.25 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0134326  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.82 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0431  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.44 
 
 
269 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.92 
 
 
282 aa  306  3e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111733  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0222  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.06 
 
 
281 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.25 
 
 
275 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26472  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.98 
 
 
272 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2476  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.02 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0264852  normal  0.0112643 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0657  enoyl-acyl-carrier-protein reductase  53.73 
 
 
275 aa  302  5.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.45449  normal  0.282453 
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.75 
 
 
272 aa  300  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.2 
 
 
272 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.37 
 
 
272 aa  299  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0857  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.59 
 
 
275 aa  299  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.59 
 
 
272 aa  298  6e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0066  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  55.68 
 
 
266 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  58.02 
 
 
286 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.59 
 
 
272 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4810  enoyl-acyl carrier protein reductase  59.14 
 
 
275 aa  297  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.368185 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.03 
 
 
272 aa  297  1e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.6 
 
 
292 aa  296  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.14 
 
 
279 aa  296  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.3 
 
 
282 aa  294  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4661  enoyl-acyl carrier protein reductase  58.75 
 
 
275 aa  294  1e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4292  enoyl-acyl carrier protein reductase  58.75 
 
 
275 aa  294  1e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.03 
 
 
282 aa  292  4e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1790  NADH dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.2 
 
 
272 aa  290  2e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00952782  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.03 
 
 
282 aa  289  3e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0032  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.92 
 
 
277 aa  289  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.236001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  56.32 
 
 
286 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  55.94 
 
 
274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  55.04 
 
 
279 aa  288  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1270  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.21 
 
 
272 aa  287  1e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.41 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.83 
 
 
279 aa  281  9e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.05 
 
 
273 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.12 
 
 
271 aa  280  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0351674  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  53.26 
 
 
272 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.58 
 
 
261 aa  277  1e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  50.97 
 
 
280 aa  277  1e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  52.49 
 
 
272 aa  277  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2204  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.77 
 
 
262 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  54.02 
 
 
275 aa  275  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  50.79 
 
 
266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.08 
 
 
262 aa  272  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0396  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.08 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.632907  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3058  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  51.72 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 
263 aa  271  7e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2468  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.96 
 
 
277 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  51.18 
 
 
255 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  51.36 
 
 
263 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  50.19 
 
 
259 aa  264  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  49.22 
 
 
256 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
256 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  50.59 
 
 
254 aa  263  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.61 
 
 
256 aa  261  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  50 
 
 
259 aa  261  6e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01265  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.28 
 
 
262 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2358  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.28 
 
 
262 aa  260  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161257  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01276  hypothetical protein  48.28 
 
 
262 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1839  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.28 
 
 
262 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000277287 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1401  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.28 
 
 
262 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0944713  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.57 
 
 
261 aa  259  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2337  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.28 
 
 
262 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1494  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.28 
 
 
262 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.247018  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1925  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  48.28 
 
 
262 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.043964  hitchhiker  0.0000000199206 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1048  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 
256 aa  259  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.62124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
257 aa  258  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1245  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  51.76 
 
 
273 aa  258  8e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.766036  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.59 
 
 
254 aa  258  9e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228784  normal  0.117413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1522  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  47.89 
 
 
262 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
254 aa  256  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3480  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  50.19 
 
 
274 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>