More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0857 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_0857  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  100 
 
 
275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  81.99 
 
 
268 aa  449  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000336187  normal  0.125543 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1051  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  77.86 
 
 
274 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2344  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  77.86 
 
 
274 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.187833  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1019  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  77.86 
 
 
274 aa  442  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0350664  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2476  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  75.75 
 
 
270 aa  430  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0264852  normal  0.0112643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0051  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  76.52 
 
 
267 aa  426  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1790  NADH dependent enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  73.38 
 
 
272 aa  414  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00952782  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0512  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  71.91 
 
 
272 aa  411  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852556  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0657  enoyl-acyl-carrier-protein reductase  71.53 
 
 
275 aa  412  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.45449  normal  0.282453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0727  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  71.32 
 
 
272 aa  408  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4769  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  72.45 
 
 
267 aa  407  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0134326  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1021  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.66 
 
 
292 aa  404  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0631  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.29 
 
 
272 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0848809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0591  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.29 
 
 
272 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152317  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3131  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  70.08 
 
 
279 aa  394  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.044421  normal  0.0801716 
 
 
-
 
NC_004310  BR0420  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.29 
 
 
272 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.7 
 
 
279 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.268862 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0428  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  69.66 
 
 
272 aa  396  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0535  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.79 
 
 
272 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1392  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.29 
 
 
273 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0905177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1140  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.66 
 
 
273 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.257606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4143  enoyl-acyl carrier protein reductase  66.91 
 
 
275 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.296445 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0396  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.15 
 
 
272 aa  388  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.632907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1211  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.28 
 
 
272 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2624  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  67.03 
 
 
279 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.325655  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1312  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  67.79 
 
 
272 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1103  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.04 
 
 
282 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0292918  normal  0.932772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4292  enoyl-acyl carrier protein reductase  65.82 
 
 
275 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4661  enoyl-acyl carrier protein reductase  65.82 
 
 
275 aa  382  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.281314 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2468  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.56 
 
 
277 aa  377  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.791611  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4810  enoyl-acyl carrier protein reductase  65.58 
 
 
275 aa  377  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356568  normal  0.368185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3448  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.05 
 
 
268 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  68.48 
 
 
282 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.111733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.06 
 
 
282 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0269  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  62.07 
 
 
280 aa  368  1e-101  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.134269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0682  enoyl-acyl carrier protein reductase  64.15 
 
 
286 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4058  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.02 
 
 
268 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5525  enoyl-acyl carrier protein reductase  62.41 
 
 
274 aa  366  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437087  normal  0.0379728 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0811  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  61.92 
 
 
266 aa  366  1e-100  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1759  enoyl-acyl carrier protein reductase  64.77 
 
 
286 aa  363  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4380  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.12 
 
 
268 aa  362  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0741  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.41 
 
 
272 aa  359  3e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2083  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.8 
 
 
272 aa  358  4e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.464026  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2171  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.8 
 
 
272 aa  358  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0550079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0347  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.62 
 
 
282 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.01 
 
 
288 aa  357  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.75394  hitchhiker  0.000398592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.1 
 
 
284 aa  356  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.234613  normal  0.190208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0052  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.42 
 
 
282 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0179  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.31 
 
 
264 aa  352  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0085  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  62.65 
 
 
261 aa  350  1e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0431  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.85 
 
 
269 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0460  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.28 
 
 
276 aa  348  5e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0868707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0426  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  66.28 
 
 
291 aa  348  7e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.185416  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.89 
 
 
277 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.917513  normal  0.103636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0611  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  60.44 
 
 
281 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.2 
 
 
276 aa  342  5e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.82 
 
 
278 aa  342  5e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.18 
 
 
282 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0222  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.16 
 
 
281 aa  341  8e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.177822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0384  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.25 
 
 
275 aa  338  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350006  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0032  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  62.02 
 
 
277 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.236001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0066  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  61.72 
 
 
266 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2227  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.52 
 
 
275 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.26472  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1270  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.15 
 
 
272 aa  332  3e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.7 
 
 
262 aa  324  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1426  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.29 
 
 
274 aa  322  3e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.89 
 
 
272 aa  318  5e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1657  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  58.5 
 
 
262 aa  317  1e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3620  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  55.04 
 
 
260 aa  316  3e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000470966  normal  0.0807844 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.2 
 
 
274 aa  315  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0043  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.47 
 
 
265 aa  315  4e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.159183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2204  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.28 
 
 
262 aa  315  8e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.2 
 
 
274 aa  314  8e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1245  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.89 
 
 
273 aa  314  9e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.766036  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0180  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  58.59 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.26134  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1751  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  56.42 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0464231  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.52 
 
 
273 aa  310  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1587  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.2 
 
 
274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0818628  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  56.2 
 
 
263 aa  305  7e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  56.13 
 
 
255 aa  304  9.000000000000001e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0780  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  54.94 
 
 
273 aa  301  6.000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.94 
 
 
262 aa  300  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1008  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.3 
 
 
262 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3176  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  58.75 
 
 
262 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3913  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.75 
 
 
262 aa  295  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.445364  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
254 aa  294  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3934  hypothetical protein  59.06 
 
 
262 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0146062  normal  0.728571 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2180  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.96 
 
 
254 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.972162  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  53.17 
 
 
255 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  55.73 
 
 
259 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.72 
 
 
256 aa  292  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.43 
 
 
260 aa  291  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00175995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  55.51 
 
 
259 aa  291  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1006  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  53.75 
 
 
254 aa  291  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
256 aa  290  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.905975  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1542  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
261 aa  289  3e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3591  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.21 
 
 
282 aa  289  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1977  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.73 
 
 
263 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240777  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1384  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.73 
 
 
263 aa  287  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>