More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1420 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1420  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 
339 aa  667    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1498  rod shape-determining protein MreB  61.4 
 
 
337 aa  410  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  58.73 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  58.73 
 
 
336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1282  rod shape-determining protein MreB  59.58 
 
 
337 aa  390  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453637  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  56.1 
 
 
343 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  54.49 
 
 
343 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  56.53 
 
 
343 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  53.15 
 
 
344 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  53.45 
 
 
344 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  53.15 
 
 
344 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  53.75 
 
 
344 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  53.45 
 
 
344 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  53.98 
 
 
339 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  56.62 
 
 
342 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  56.62 
 
 
342 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  53.1 
 
 
344 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  53.45 
 
 
344 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  55.05 
 
 
340 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  53.29 
 
 
343 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 
344 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  53.78 
 
 
347 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  54.38 
 
 
347 aa  362  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  53.27 
 
 
343 aa  363  3e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
346 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  52.85 
 
 
340 aa  361  8e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2619  rod shape-determining protein Mbl  53.21 
 
 
344 aa  360  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000422129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  53.78 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  52.76 
 
 
345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  53.66 
 
 
340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  54.71 
 
 
338 aa  354  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  51.22 
 
 
346 aa  353  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3102  rod shape-determining protein Mbl  51.08 
 
 
342 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.281703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  54.77 
 
 
358 aa  352  8e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  54.77 
 
 
358 aa  350  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  53.82 
 
 
335 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  52.38 
 
 
347 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  52.57 
 
 
347 aa  350  3e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  50.76 
 
 
344 aa  348  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  52.69 
 
 
345 aa  347  2e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
343 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18111  rod shape-determining protein MreB  52.91 
 
 
350 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  52.11 
 
 
345 aa  347  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  51.66 
 
 
347 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  49.85 
 
 
343 aa  347  2e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  49.24 
 
 
346 aa  346  3e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
347 aa  346  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
347 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  52.42 
 
 
343 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.73 
 
 
344 aa  345  5e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  51.06 
 
 
348 aa  345  5e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
339 aa  345  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
339 aa  345  7e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 
346 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0109  rod shape-determining protein Mbl  53.07 
 
 
343 aa  345  8e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00501593  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
339 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
339 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
339 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
339 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
339 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
339 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  52.27 
 
 
339 aa  345  8.999999999999999e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17481  rod shape-determining protein MreB  52.4 
 
 
360 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  50.45 
 
 
350 aa  344  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  52.91 
 
 
339 aa  344  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  50.46 
 
 
346 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20741  rod shape-determining protein MreB  53.21 
 
 
350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.637014  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1199  rod shape-determining protein MreB  53.21 
 
 
350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  51.32 
 
 
347 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  52.6 
 
 
359 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.57 
 
 
344 aa  342  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  51.96 
 
 
339 aa  342  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 
346 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0105  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 
350 aa  342  5.999999999999999e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  51.2 
 
 
354 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  52.44 
 
 
338 aa  342  7e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  52.74 
 
 
340 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0149  rod shape-determining protein MreB  52.4 
 
 
350 aa  341  1e-92  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.126698  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  53.52 
 
 
350 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  50.61 
 
 
339 aa  341  1e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3282  rod shape-determining protein Mbl  52.01 
 
 
333 aa  340  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000125947  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  53.52 
 
 
350 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  54.22 
 
 
346 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3394  rod shape-determining protein Mbl  51.39 
 
 
333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  50.91 
 
 
347 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  53.52 
 
 
424 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  49.09 
 
 
345 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 
368 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  47.15 
 
 
342 aa  339  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  53.54 
 
 
349 aa  338  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  50.15 
 
 
346 aa  338  5.9999999999999996e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4130  rod shape-determining protein MreB  54.09 
 
 
335 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 
346 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  52.81 
 
 
347 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  52.81 
 
 
348 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1917  rod shape-determining protein MreB  48.66 
 
 
340 aa  337  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.695972  hitchhiker  0.000105138 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2133  rod shape-determining protein Mbl  48.77 
 
 
343 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01791  rod shape-determining protein MreB  51.5 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  49.55 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  50.3 
 
 
343 aa  336  2.9999999999999997e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>