More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1282 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1282  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 337 aa  664    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453637  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1498  rod shape-determining protein MreB  74.48 
 
 		 337 aa  513  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0348  rod shape-determining protein MreB  72.21 
 
 		 336 aa  496  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0865019  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0330  rod shape-determining protein MreB  72.21 
 
 		 336 aa  496  1e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000934452  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1420  rod shape-determining protein MreB  59.58 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  59.58 
 
 		 344 aa  374  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  57.78 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  58.01 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  58.01 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  56.63 
 
 		 340 aa  371  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 		 339 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 		 346 aa  368  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  55.65 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  56.76 
 
 		 343 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 340 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  56.71 
 
 		 343 aa  362  4e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 		 343 aa  362  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2549  rod shape-determining protein MreB  55.19 
 
 		 339 aa  359  3e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0140838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1150  rod shape-determining protein MreB  53.96 
 
 		 345 aa  359  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00564796 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  53.41 
 
 		 345 aa  358  8e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1199  rod shape-determining protein MreB  52.82 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  54.38 
 
 		 347 aa  357  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20741  rod shape-determining protein MreB  52.82 
 
 		 350 aa  358  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.637014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.36 
 
 		 350 aa  357  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17481  rod shape-determining protein MreB  52.82 
 
 		 360 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  52.41 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  55.25 
 
 		 343 aa  356  2.9999999999999997e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  53.47 
 
 		 344 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  53.27 
 
 		 344 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18111  rod shape-determining protein MreB  51.63 
 
 		 350 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165952  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0866  MreB/Mrl family cell shape determining protein  54.13 
 
 		 335 aa  355  5e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0636384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  53.27 
 
 		 344 aa  355  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  53.5 
 
 		 347 aa  355  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  52.98 
 
 		 344 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  54.08 
 
 		 347 aa  355  8.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3391  rod shape-determining protein MreB  54.57 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.112256 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0900  rod shape-determining protein MreB  55.09 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01791  rod shape-determining protein MreB  53.1 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  52.68 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 344 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  52.87 
 
 		 344 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  53.52 
 
 		 343 aa  352  4e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  52.57 
 
 		 344 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0149  rod shape-determining protein MreB  52.23 
 
 		 350 aa  352  5e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.126698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  54.08 
 
 		 347 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  55.72 
 
 		 340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0105  rod shape-determining protein MreB  51.93 
 
 		 350 aa  351  8e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.757338 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4170  rod shape-determining protein MreB  54.27 
 
 		 349 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000201977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  53.75 
 
 		 347 aa  350  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  53.75 
 
 		 347 aa  350  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  54.33 
 
 		 338 aa  350  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1715  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18321  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 350 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4130  rod shape-determining protein MreB  54.13 
 
 		 335 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  53.31 
 
 		 343 aa  349  3e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.01 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  54.49 
 
 		 338 aa  349  4e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1824  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  54.81 
 
 		 344 aa  349  4e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18141  rod shape-determining protein MreB  51.34 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.208246  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  53.31 
 
 		 343 aa  349  5e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  55.12 
 
 		 368 aa  348  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  53.15 
 
 		 345 aa  348  6e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  7e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4298  rod shape-determining protein MreB  53.57 
 
 		 339 aa  348  7e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  53.43 
 
 		 348 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  52.85 
 
 		 347 aa  345  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2468  MreB/Mrl family cell shape determining protein  52.74 
 
 		 343 aa  345  6e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.560216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  53.61 
 
 		 347 aa  345  6e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  55.09 
 
 		 342 aa  345  6e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  52.98 
 
 		 347 aa  345  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.19 
 
 		 344 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  52.4 
 
 		 343 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  54.08 
 
 		 342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  52.41 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  53.68 
 
 		 349 aa  340  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  51.47 
 
 		 346 aa  340  2e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  52.37 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.27 
 
 		 344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  53.23 
 
 		 336 aa  339  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  55.25 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  51.47 
 
 		 346 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  51.47 
 
 		 346 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  53.82 
 
 		 347 aa  338  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1283  rod shape-determining protein MreB  54.94 
 
 		 358 aa  338  9e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.852802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1191  rod shape-determining protein MreB  54.24 
 
 		 359 aa  337  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000240311  hitchhiker  0.00107444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  53.59 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  53.59 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  51.05 
 
 		 346 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  53.59 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  53.59 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  53.59 
 
 		 345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  54.15 
 
 		 339 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>