217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1614 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
333 aa  663    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1635  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  80.66 
 
 
331 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0159123  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4175  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  80.06 
 
 
336 aa  537  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0829517  normal  0.555265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  80.42 
 
 
336 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3845  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  78.85 
 
 
331 aa  533  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  80 
 
 
333 aa  531  1e-150  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  79.7 
 
 
333 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  79.39 
 
 
334 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  78.18 
 
 
332 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  77.58 
 
 
332 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14760  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  78.08 
 
 
333 aa  475  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.85 
 
 
330 aa  285  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.66 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.22 
 
 
337 aa  280  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.61 
 
 
335 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.68 
 
 
335 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.68 
 
 
335 aa  276  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.93 
 
 
339 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.77 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.9 
 
 
331 aa  273  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.32 
 
 
339 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.94 
 
 
335 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.99 
 
 
339 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.36 
 
 
335 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.24 
 
 
336 aa  268  7e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.35 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.35 
 
 
328 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.35 
 
 
328 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.35 
 
 
328 aa  265  1e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.35 
 
 
328 aa  265  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.35 
 
 
328 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.35 
 
 
328 aa  265  1e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  49.35 
 
 
328 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.45 
 
 
326 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.03 
 
 
328 aa  263  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.61 
 
 
331 aa  262  6.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.07 
 
 
328 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.07 
 
 
328 aa  261  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.07 
 
 
328 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.69 
 
 
335 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.35 
 
 
333 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.55 
 
 
333 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.83 
 
 
325 aa  256  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.69 
 
 
335 aa  256  4e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.73 
 
 
349 aa  256  5e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.58 
 
 
335 aa  256  6e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.49 
 
 
339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.22 
 
 
330 aa  252  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.63 
 
 
338 aa  252  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.66 
 
 
335 aa  250  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.6 
 
 
353 aa  249  6e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.37 
 
 
325 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.87 
 
 
325 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.37 
 
 
325 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.37 
 
 
325 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.93 
 
 
335 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.81 
 
 
385 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.04 
 
 
325 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.92 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.63 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.01 
 
 
323 aa  239  5.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.36 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1782  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.37 
 
 
323 aa  238  8e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.17 
 
 
331 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0594  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.77 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0823349 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.61 
 
 
341 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.56 
 
 
325 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.25 
 
 
325 aa  230  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  40.6 
 
 
349 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.33 
 
 
337 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.27 
 
 
338 aa  226  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  47.7 
 
 
333 aa  225  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2126  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.38 
 
 
343 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0289041  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40 
 
 
375 aa  223  4e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2152  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.36 
 
 
345 aa  223  4.9999999999999996e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.101356  normal  0.391691 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0354  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.63 
 
 
339 aa  222  7e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82798  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0901  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.65 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0453092  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  47.28 
 
 
335 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.27 
 
 
327 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0390  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.99 
 
 
339 aa  215  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0958  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.96 
 
 
335 aa  209  8e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.25 
 
 
336 aa  207  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2059  lipid-A-disaccharide synthase  37.83 
 
 
361 aa  203  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  42.28 
 
 
329 aa  202  8e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.09 
 
 
346 aa  194  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0489  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.32 
 
 
332 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0649  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.32 
 
 
332 aa  194  2e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.65 
 
 
363 aa  186  7e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.5 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.17 
 
 
366 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.7 
 
 
372 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1727  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.82 
 
 
340 aa  176  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.159463  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0312  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.65 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.99 
 
 
338 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.95 
 
 
338 aa  170  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.99 
 
 
338 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.4 
 
 
348 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2807  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.5 
 
 
349 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0758869  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.67 
 
 
343 aa  160  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.29623  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>