20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0886 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0886  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.236467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2228  hypothetical protein  67.23 
 
 		 242 aa  335  5e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0127377  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0873  hypothetical protein  66.67 
 
 		 239 aa  333  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581637  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3326  hypothetical protein  62.34 
 
 		 240 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.667042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2418  hypothetical protein  61.04 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4175  hypothetical protein  39.34 
 
 		 244 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112176  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2955  hypothetical protein  36.13 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1366  hypothetical protein  33.94 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336133  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2803  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  32.19 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1473  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.51 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1189  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  28.99 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205145  normal  0.021926 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1311  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  26.64 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.306874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3113  putative cobalt transport system, periplasmic-binding protein  29.52 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5110  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  26.75 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.914835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1349  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.57 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1129  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  27.52 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0480358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2036  hypothetical protein  28.21 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5179  putative ABC-type Co2+ transport system, periplasmic component  31.65 
 
 		 263 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.81445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4085  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  26.46 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1251  ABC-type Co2+ transport system periplasmic component-like protein  24.54 
 
 		 252 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>