21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1905 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1905  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  306  5e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.561511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2243  mobile mystery protein A  75.66 
 
 		 152 aa  240  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0742  transcriptional regulator, XRE family  70.39 
 
 		 152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149727  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2564  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1390  DNA-binding protein  38.19 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3533  transcriptional regulator, XRE family  38.82 
 
 		 176 aa  97.8  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3298  DNA-binding protein  43.8 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0001  helix-turn-helix domain containing protein  31.58 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.998773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0039  mobile mystery protein A  30.92 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1582  mobile mystery protein A  35.76 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4246  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0005  mobile mystery protein A  37.3 
 
 		 171 aa  84  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4942  mobile mystery protein A  36.92 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  39.29 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0170  DNA-binding protein  40.86 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1697  helix-turn-helix domain-containing protein  36.78 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  36.71 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0273  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.3 
 
 		 376 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  38.46 
 
 		 194 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>