16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0742 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0742  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 152 aa  309  9e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149727  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1905  XRE family transcriptional regulator  70.39 
 
 		 152 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.561511 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2243  mobile mystery protein A  68.42 
 
 		 152 aa  227  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2564  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1390  DNA-binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0001  helix-turn-helix domain containing protein  33.55 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.998773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0039  mobile mystery protein A  32.89 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3298  DNA-binding protein  34.56 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1582  mobile mystery protein A  39.37 
 
 		 170 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3533  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 176 aa  84.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4246  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 162 aa  84  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4942  mobile mystery protein A  43.14 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0005  mobile mystery protein A  35.71 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  36.04 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1697  helix-turn-helix domain-containing protein  35.9 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0170  DNA-binding protein  36.56 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>