18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2564 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2564  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 153 aa  308  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3533  transcriptional regulator, XRE family  68.42 
 
 		 176 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1390  DNA-binding protein  58.97 
 
 		 156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0001  helix-turn-helix domain containing protein  44.67 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.998773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0039  mobile mystery protein A  44 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3298  DNA-binding protein  40.26 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4942  mobile mystery protein A  38.82 
 
 		 170 aa  117  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1905  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.561511 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  37.32 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1582  mobile mystery protein A  38.71 
 
 		 170 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0170  DNA-binding protein  48.42 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0742  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149727  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2243  mobile mystery protein A  43.65 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0005  mobile mystery protein A  38.73 
 
 		 171 aa  98.2  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4246  XRE family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1697  helix-turn-helix domain-containing protein  39.81 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1652  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000422118  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0041  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0512908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>