20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3298 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3298  DNA-binding protein  100 
 
 		 156 aa  303  7e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1390  DNA-binding protein  41.29 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0001  helix-turn-helix domain containing protein  42 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.998773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0039  mobile mystery protein A  41.33 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4942  mobile mystery protein A  45.95 
 
 		 170 aa  120  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  48.94 
 
 		 154 aa  121  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2564  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 153 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3533  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0005  mobile mystery protein A  46.1 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2243  mobile mystery protein A  40.28 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1905  XRE family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.561511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1582  mobile mystery protein A  34.01 
 
 		 170 aa  94  7e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4246  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0742  transcriptional regulator, XRE family  34.56 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149727  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1697  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0170  DNA-binding protein  35.79 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  49.09 
 
 		 84 aa  44.3  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1652  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000422118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>