17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1697 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1697  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 146 aa  296  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3533  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0005  mobile mystery protein A  40.95 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1390  DNA-binding protein  38.05 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3298  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4246  XRE family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0039  mobile mystery protein A  36.36 
 
 		 152 aa  72  0.000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  33.81 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0001  helix-turn-helix domain containing protein  36.36 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.998773  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2564  transcriptional regulator, XRE family  39.81 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1582  mobile mystery protein A  40.51 
 
 		 170 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0742  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 152 aa  67  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149727  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1905  XRE family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.561511 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4942  mobile mystery protein A  36 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2243  mobile mystery protein A  38.81 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0170  DNA-binding protein  40.38 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3542  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>