18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_A0001 on replicon NC_009726
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009726  CBUD_A0001  helix-turn-helix domain containing protein  100 
 
 		 152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.998773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0039  mobile mystery protein A  98.68 
 
 		 152 aa  301  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2564  transcriptional regulator, XRE family  44.67 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3533  transcriptional regulator, XRE family  42.67 
 
 		 176 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4942  mobile mystery protein A  43.42 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3298  DNA-binding protein  42 
 
 		 156 aa  124  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1390  DNA-binding protein  43.55 
 
 		 156 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0005  mobile mystery protein A  40 
 
 		 171 aa  97.8  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1582  mobile mystery protein A  34.03 
 
 		 170 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  40.68 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0742  transcriptional regulator, XRE family  33.55 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149727  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2243  mobile mystery protein A  33.55 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1905  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.561511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0170  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 108 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4246  XRE family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 162 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1697  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0041  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0512908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1652  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000422118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>