16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3533 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3533  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 176 aa  359  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2564  transcriptional regulator, XRE family  68.42 
 
 		 153 aa  214  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1390  DNA-binding protein  60.39 
 
 		 156 aa  194  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0001  helix-turn-helix domain containing protein  42.67 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.998773  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0039  mobile mystery protein A  42 
 
 		 152 aa  126  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3298  DNA-binding protein  40.79 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  40.27 
 
 		 154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4942  mobile mystery protein A  39.73 
 
 		 170 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1905  XRE family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 152 aa  97.8  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.561511 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0170  DNA-binding protein  48.42 
 
 		 108 aa  97.8  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1582  mobile mystery protein A  37.3 
 
 		 170 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0005  mobile mystery protein A  37.09 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2243  mobile mystery protein A  41.73 
 
 		 152 aa  94  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4246  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0742  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 152 aa  84.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149727  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1697  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 146 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>