16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1390 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1390  DNA-binding protein  100 
 
 		 156 aa  308  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3533  transcriptional regulator, XRE family  60.39 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2564  transcriptional regulator, XRE family  58.97 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3298  DNA-binding protein  41.29 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.441123  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0039  mobile mystery protein A  43.55 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0001  helix-turn-helix domain containing protein  43.55 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.998773  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4942  mobile mystery protein A  43.45 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0005  mobile mystery protein A  40.13 
 
 		 171 aa  110  7.000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0170  DNA-binding protein  57.14 
 
 		 108 aa  107  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2243  mobile mystery protein A  40.97 
 
 		 152 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1582  mobile mystery protein A  36.67 
 
 		 170 aa  107  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5363  mobile mystery protein A  38.89 
 
 		 154 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.084336 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1905  XRE family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.561511 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4246  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000130634 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0742  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.149727  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1697  helix-turn-helix domain-containing protein  38.05 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>