39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2128 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2128  Bacteriophage capsid protein-like protein  100 
 
 		 494 aa  1021    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1875  lambda family phage portal protein  23.46 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1335  Bacteriophage capsid protein-like protein  23.36 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3174  phage portal protein, lambda  25.52 
 
 		 536 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1062  lambda family phage portal protein  25.91 
 
 		 517 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.544007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0136  lambda family phage portal protein  26.06 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1204  lambda family phage portal protein  23.49 
 
 		 531 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3250  phage portal protein, lambda  26.5 
 
 		 524 aa  60.1  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3359  lambda family phage portal protein  24.22 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.591009 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3783  bacteriophage-related protein lambda family phage portal protein  24.22 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.401598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1677  phage portal protein, lambda family protein  25.28 
 
 		 519 aa  55.1  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1887  lambda family phage portal protein  20.24 
 
 		 556 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000167275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1300  phage portal protein, lambda  21.64 
 
 		 537 aa  53.5  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.616273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3599  lambda family phage portal protein  23.6 
 
 		 524 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1070  phage portal protein lambda family  23.62 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.815422  hitchhiker  0.0000926741 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0782  phage portal protein, lambda family  23.6 
 
 		 524 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.339104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0755  lambda family phage portal protein  23.6 
 
 		 524 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0786  lambda family phage portal protein  23.6 
 
 		 524 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0469703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1142  phage portal protein, lambda family  23.32 
 
 		 515 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.57853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1407  phage portal protein, lambda family  23.23 
 
 		 515 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.981703  hitchhiker  0.000144883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0596  phage portal protein, lambda family  23.13 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1863  phage portal protein, lambda family  25.66 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353733 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3203  phage portal protein, lambda family  25.66 
 
 		 500 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3410  portal protein  21.75 
 
 		 493 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.797214  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0679  Phage portal protein, lambda  22.32 
 
 		 482 aa  47  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.468195  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2660  prophage LambdaMc01, lambda family portal protein  24.12 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1171  lambda family phage portal protein  21.78 
 
 		 528 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1197  lambda family phage portal protein  22.19 
 
 		 488 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0224747 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1658  lambda family phage portal protein  23.81 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805551  normal  0.257873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3207  phage portal protein, lambda family  23.05 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1151  phage-related portal protein  21.6 
 
 		 528 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0694  phage portal protein, lambda family  24.14 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000299773 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0412  phage-related portal protein  21.6 
 
 		 528 aa  45.1  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3064  putative phage portal protein Gp17  21.24 
 
 		 551 aa  45.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0202724  hitchhiker  0.000118688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3044  lambda family phage portal protein  20.91 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426475  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1188  phage portal protein, lambda family  22.11 
 
 		 530 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2775  phage portal protein, lambda family  22.11 
 
 		 530 aa  44.3  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3134  putative phage portal protein, lambda family  25.82 
 
 		 1156 aa  43.9  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244044 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3432  lambda family phage portal protein  19.67 
 
 		 588 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>