73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1164 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1164  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  100 
 
 		 475 aa  976    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3256  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  50.21 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149717  normal  0.233846 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2682  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  50 
 
 		 505 aa  450  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1872  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  48.58 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4671  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  46.33 
 
 		 499 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.268952  hitchhiker  0.00000156753 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0443  magnesium chelatase subunit ChlI  46.84 
 
 		 475 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0370  Mg-chelatase subunit ChlI  46.28 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.591136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0006  magnesium chelatase, subunit ChlI  47.21 
 
 		 512 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal  0.114957 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2429  magnesium protoporphyrin chelatase putative  46.76 
 
 		 473 aa  390  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3739  magnesium chelatase, subunit ChlI  46.09 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0412  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  45.22 
 
 		 486 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08801  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  44.05 
 
 		 487 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0326  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  44.35 
 
 		 510 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1892  magnesium chelatase, ChlI subunit  44.37 
 
 		 463 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.460358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4336  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  48.7 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1054  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  45.82 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1093  magnesium chelatase related protein  44.75 
 
 		 473 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0934  putative magnesium chelatase  44.12 
 
 		 511 aa  368  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.550686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1378  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  43.13 
 
 		 480 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1097  magnesium chelatase, ChlI subunit  43.63 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.3392 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3114  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.07 
 
 		 469 aa  354  2e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.53029  hitchhiker  0.0000243059 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1986  putative magnesium chelatase  40.86 
 
 		 469 aa  350  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.106493  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0311  magnesium chelatase, ChlI subunit  42.53 
 
 		 460 aa  350  4e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0952  putative magnesium chelatase subunit ChlI  41.7 
 
 		 462 aa  346  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1877  putative magnesium chelatase  44.44 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22300  Mg-chelatase subunit ChlI  41.44 
 
 		 475 aa  346  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.102515  normal  0.184518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0823  putative magnesium chelatase  41.56 
 
 		 503 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.421013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8559  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  43.23 
 
 		 465 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0090  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.39 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3299  magnesium chelatase subunit ChlI  40.78 
 
 		 473 aa  340  5e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4854  putative magnesium chelatase  43.03 
 
 		 463 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.454565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4694  putative magnesium chelatase  43.93 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0396421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4314  putative magnesium chelatase  43.93 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.569649  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4400  putative magnesium chelatase  43.93 
 
 		 461 aa  338  9e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.803447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2192  magnesium protoporphyrin chelatase, putative  41.03 
 
 		 461 aa  335  7e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1769  putative magnesium chelatase  40.47 
 
 		 478 aa  333  4e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000539061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10976  magnesium chelatase  43.56 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.915369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3905  magnesium chelatase, ChlI subunit  42.42 
 
 		 507 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0246892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0551  Mg-chelatase subunit ChlI-like protein  48.79 
 
 		 464 aa  321  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0511  ATPase  28.86 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.269432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.73 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0954  ATPase  26.63 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.44 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.44 
 
 		 358 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.87 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.86 
 
 		 364 aa  50.4  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  29.03 
 
 		 405 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.54 
 
 		 340 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0850  ATPase  26.27 
 
 		 304 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.243473 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.1 
 
 		 373 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  27.87 
 
 		 362 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  28.4 
 
 		 357 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1915  ATPase  25.73 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  26.52 
 
 		 363 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.22 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2825  Fis family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 589 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.208492  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  24.82 
 
 		 340 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0445  magnesium chelatase  24.47 
 
 		 402 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  29.63 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  27.46 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1746  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.22 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156999  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  25 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  28.32 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  26.43 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1403  ATPase  28.7 
 
 		 306 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  22.12 
 
 		 327 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4102  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0970  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.17 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  hitchhiker  0.00000223455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1326  putative sigma54 specific transcriptional regulator  32.58 
 
 		 540 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101296  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1776  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  30.56 
 
 		 456 aa  43.5  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  26.55 
 
 		 334 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  26.24 
 
 		 334 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  26.24 
 
 		 334 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>