More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1111 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1111  HesB/YadR/YfhF-family protein  100 
 
 
164 aa  343  8.999999999999999e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.43 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.46 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  36.46 
 
 
119 aa  68.6  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  34.38 
 
 
119 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  29.81 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3154  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.73 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.889922  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.58 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2522  scaffold protein for iron-sulphur cluster assembly  32.26 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3261  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.43 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347724  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.36 
 
 
133 aa  62  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2084  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.43 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.57 
 
 
120 aa  61.2  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1456  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.35 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0753774  normal  0.435352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.41 
 
 
120 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.25 
 
 
118 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  decreased coverage  0.00532589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.62 
 
 
115 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3146  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.57 
 
 
120 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12232  hypothetical protein  29.63 
 
 
118 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000227512  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15600  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  26.6 
 
 
116 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722466  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3536  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.85 
 
 
120 aa  58.9  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0677815  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16270  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.72 
 
 
119 aa  58.2  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.591813  normal  0.329792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.21 
 
 
124 aa  58.2  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7775  HesB/YadR/YfhF-family protein  28.89 
 
 
132 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178279  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7744  HesB/YadR/YfhF-family protein  28.89 
 
 
132 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1561  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.26 
 
 
108 aa  57.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.571955 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1955  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  28.57 
 
 
128 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000220764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.66 
 
 
117 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3082  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  35.53 
 
 
119 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0030958  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3302  HesB/YadR/YfhF  33.77 
 
 
120 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.98 
 
 
120 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3313  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.77 
 
 
120 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3364  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  33.77 
 
 
120 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0837233 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3315  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  24.63 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0790107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12230  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.59 
 
 
130 aa  56.6  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.40084  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2021  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.29 
 
 
110 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0952421  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1083  HesB/YadR/YfhF  30.21 
 
 
106 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  31.94 
 
 
117 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  24.32 
 
 
119 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.324909  hitchhiker  0.0039414 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2218  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.55 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0238312  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.03 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2945  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.47 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648608  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10610  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.21 
 
 
125 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.213974 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3064  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.47 
 
 
119 aa  55.1  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323764  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0979  HesB/YadR/YfhF  30.21 
 
 
106 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.29141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5822  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  26.88 
 
 
108 aa  55.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.609352 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.43 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1342  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.98 
 
 
115 aa  54.7  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.269894  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3568  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.47 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0534346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.66 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1650  HesB/YadR/YfhF  27.84 
 
 
107 aa  54.7  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14110  Iron-sulfur cluster assembly accessory protein  25 
 
 
118 aa  54.3  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3258  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  31.88 
 
 
122 aa  53.9  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0083346  hitchhiker  0.0000911572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3150  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.11 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.654689  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  25.51 
 
 
120 aa  53.9  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  28.72 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3060  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  26.6 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000000628621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5091  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.11 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.66 
 
 
117 aa  52.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  25.49 
 
 
116 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1447  HesB/YadR/YfhF  26.6 
 
 
135 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0113719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1530  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  34.21 
 
 
117 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1576  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  27.08 
 
 
136 aa  52.4  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.717654  normal  0.472195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1859  HesB/YadR/YfhF  34.74 
 
 
117 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  26.32 
 
 
122 aa  51.6  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0283  HesB-family protein  28.57 
 
 
107 aa  51.6  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1363  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.47 
 
 
107 aa  51.2  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0844  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.32 
 
 
107 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1134  iron-sulfur cluster assembly protein  28.57 
 
 
107 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0874  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.32 
 
 
107 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.301762 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04435  Scaffold protein for iron-sulfur cluster assembly  29.9 
 
 
125 aa  51.2  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.45282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0887  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  32.32 
 
 
107 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553032  hitchhiker  0.000153818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0206  HesB/YadR/YfhF family protein  26.73 
 
 
127 aa  50.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1289  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.13 
 
 
116 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4453  HesB/YadR/YfhF  29.03 
 
 
106 aa  50.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  27.96 
 
 
117 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2595  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  32.32 
 
 
130 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.912674  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  27.96 
 
 
117 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  27.96 
 
 
117 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  27.96 
 
 
117 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0106  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  30.43 
 
 
106 aa  50.8  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.809451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5909  Iron-binding protein IscA (iron-sulfur cluster assembly protein)  30.21 
 
 
107 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4552  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  25.81 
 
 
138 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.685133  normal  0.324174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  27.96 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  27.96 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  27.96 
 
 
130 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2315  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  29.59 
 
 
107 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.608398  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1246  iron-sulfur cluster assembly protein  30.14 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434488  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0066  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.79 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1240  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  35.62 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  26.88 
 
 
117 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1041  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.79 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0167  hesB/yadR/yfhF family protein  29.03 
 
 
117 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  29.79 
 
 
121 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01610  Nitrogen fixation Fe-S cluster assembly protein IscAnif  33.33 
 
 
107 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5073  hesB/yadR/yfhF family protein  27.96 
 
 
130 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  23.02 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0961  HesB/YadR/YfhF  27.37 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1566  iron-sulfur cluster assembly protein IscA  28.12 
 
 
107 aa  49.7  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3029  iron-sulfur cluster assembly protein  30.14 
 
 
107 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>