More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0066 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0066  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0864  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  70.3 
 
 
117 aa  147  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.470535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2887  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.46 
 
 
120 aa  110  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2772  HesB/YadR/YfhF  47.57 
 
 
141 aa  107  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1413  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.54 
 
 
118 aa  106  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3032  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
121 aa  105  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3663  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.69 
 
 
148 aa  104  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.549056  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  46.43 
 
 
130 aa  103  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.6 
 
 
123 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0601  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.6 
 
 
123 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00222893  normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0575  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.6 
 
 
123 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103846  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2702  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.57 
 
 
123 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.840574  normal  0.551617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0648  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.57 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0198  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.57 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0800429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.57 
 
 
123 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.96 
 
 
147 aa  101  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000130443  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.96 
 
 
132 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.96 
 
 
132 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.96 
 
 
132 aa  100  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1303  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.18 
 
 
116 aa  100  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00012282 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1285  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
117 aa  100  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.257084 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
122 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2343  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
122 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3419  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
122 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000312086  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
122 aa  100  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000525551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3121  HesB/YadR/YfhF  41.44 
 
 
120 aa  100  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105861  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
122 aa  100  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
122 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0255  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
122 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1117  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
122 aa  100  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0940  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
119 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0204493  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0959  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.19 
 
 
119 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0861768  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.04 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0526  HesB domain-containing protein  44.23 
 
 
119 aa  98.6  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.255563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.09 
 
 
132 aa  99  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0472  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.66 
 
 
107 aa  99  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.04 
 
 
109 aa  98.6  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.22 
 
 
116 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0323  HesB/YadR/YfhF  45.63 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000000123552  hitchhiker  0.00657769 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.73 
 
 
116 aa  98.2  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.22 
 
 
116 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0414  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.67 
 
 
122 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.02027  normal  0.0298557 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2279  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.95 
 
 
130 aa  97.8  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000000652366  hitchhiker  0.00000000102221 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0658  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
110 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.393107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0053  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.72 
 
 
109 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  47.66 
 
 
113 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2978  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
110 aa  97.4  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2733  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.81 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  47.06 
 
 
116 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.06 
 
 
116 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.67 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.67 
 
 
124 aa  96.7  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1664  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.71 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.138511 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.35 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.35 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0240  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
120 aa  95.5  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1291  HesB/YadR/YfhF  44.66 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0112575  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0556  HesB/YadR/YfhF  46.67 
 
 
113 aa  95.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.208955  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3352  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.71 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00016934  hitchhiker  0.0000376167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0609  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.71 
 
 
121 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000901773  normal  0.437639 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0403  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.67 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0292839  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.71 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2562  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.67 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000254091  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1797  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  42.31 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.654159  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  44.76 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.48 
 
 
114 aa  94.4  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.48 
 
 
114 aa  94.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  42.48 
 
 
114 aa  94.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0954  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.23 
 
 
133 aa  94.7  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.557942  normal  0.360876 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  44.76 
 
 
117 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.19 
 
 
116 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.54 
 
 
114 aa  94.4  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.08 
 
 
124 aa  94  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.08 
 
 
124 aa  94  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
110 aa  94  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2665  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  43.81 
 
 
117 aa  94  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.840353  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.62 
 
 
121 aa  93.6  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0535  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.86 
 
 
121 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110729  normal  0.812504 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5044  hesB/yadR/yfhF family protein  47.57 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0875  HesB/YadR/YfhF family protein  46.6 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.699772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5078  hesB/yadR/yfhF family protein  47.57 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4805  hesB/yadR/yfhF family protein  47.57 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4646  hypothetical protein  47.57 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4666  hypothetical protein  47.57 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4755  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.57 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1509  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00886553  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1011  HesB/YadR/YfhF  38.89 
 
 
116 aa  92.8  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.752752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3544  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  46.6 
 
 
117 aa  92.8  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5169  hesB/yadR/yfhF family protein  47.57 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3304  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.27 
 
 
120 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3349  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  40 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0866  HesB/YadR/YfhF family protein  46.6 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3153  putative HesB-like protein  46.15 
 
 
121 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00937161 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2408  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.71 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00136541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5075  hesB/yadR/yfhF family protein  47.57 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2353  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.57 
 
 
108 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.130413  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1227  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.62 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000951684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.12 
 
 
121 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  44.66 
 
 
117 aa  92  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>