28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3529 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3529  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  346  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.452767  normal  0.831541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1206  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  346  8e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4017  hypothetical protein  51.43 
 
 		 207 aa  170  7.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0579  hypothetical protein  50.85 
 
 		 185 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.336002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0712  hypothetical protein  46.89 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.583463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3174  hypothetical protein  51.72 
 
 		 150 aa  108  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0525  hypothetical protein  39.88 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3838  hypothetical protein  46.62 
 
 		 163 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0788301  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1514  hypothetical protein  45.13 
 
 		 131 aa  84  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.338897 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3074  hypothetical protein  39.29 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2247  hypothetical protein  35.09 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3815  hypothetical protein  47.79 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.757001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3345  hypothetical protein  41.35 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.126619  normal  0.961104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3911  hypothetical protein  33.52 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3017  hypothetical protein  34.66 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0761  hypothetical protein  35.38 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2866  hypothetical protein  31.11 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.0242431 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3182  hypothetical protein  42.59 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00860952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7729  hypothetical protein  62.75 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0250143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0127  hypothetical protein  33.85 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.488443  normal  0.651433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3067  hypothetical protein  56.25 
 
 		 58 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7429  hypothetical protein  42.31 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3560  hypothetical protein  34.06 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3365  hypothetical protein  32.76 
 
 		 124 aa  52  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.828629  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1487  hypothetical protein  38.46 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1036  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.128051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1810  hypothetical protein  42.65 
 
 		 261 aa  47.8  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187733  normal  0.988109 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2339  hypothetical protein  32.11 
 
 		 148 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>