More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2411 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2411  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
320 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3065  alcohol dehydrogenase  73.44 
 
 
325 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578472  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2635  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.28 
 
 
322 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2372  zinc-binding alcohol dehydrogenase  48.75 
 
 
319 aa  302  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1358  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.19 
 
 
319 aa  248  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3541  alcohol dehydrogenase  46.56 
 
 
319 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0820783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5231  oxidoreductase, zinc-binding protein  38.11 
 
 
325 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2709  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  38.65 
 
 
327 aa  189  5e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3191  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  36.09 
 
 
328 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0472649  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1137  quinone oxidoreductase putative PIG3  36.11 
 
 
327 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0153102  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5445  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.84 
 
 
325 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836594 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0313  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  38.11 
 
 
328 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1944  quinone oxidoreductase  34.56 
 
 
328 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0819038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1965  quinone oxidoreductase  34.86 
 
 
328 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2113  quinone oxidoreductase  34.86 
 
 
328 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2265  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.86 
 
 
328 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.846418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2147  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  34.25 
 
 
328 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1957  alcohol dehydrogenase  35.17 
 
 
328 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0178184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2529  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.89 
 
 
322 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3745  alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
329 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1920  quinone oxidoreductase  34.77 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2527  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  38.46 
 
 
323 aa  179  7e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.450235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2194  quinone oxidoreductase  34.25 
 
 
328 aa  178  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0247156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4404  PIG3 family NAD(P)H quinone oxidoreductase  34.45 
 
 
337 aa  178  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.462474  normal  0.880778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0313  alcohol dehydrogenase  36.28 
 
 
326 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1807  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.08 
 
 
324 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01063  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.23 
 
 
324 aa  177  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.27847  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3201  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  37.73 
 
 
324 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2123  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.85 
 
 
328 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2092  quinone oxidoreductase putative PIG3  35.89 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187867  hitchhiker  0.000106437 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5033  alcohol dehydrogenase  35.47 
 
 
325 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69110  putative oxidoreductase  35.08 
 
 
325 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5977  putative oxidoreductase  35.08 
 
 
325 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6140  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.66 
 
 
328 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0930  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.74 
 
 
324 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5271  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
325 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3512  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.85 
 
 
321 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  36.62 
 
 
325 aa  168  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342791  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5119  alcohol dehydrogenase  34.97 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3496  quinone oxidoreductase  33.85 
 
 
321 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2354  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36.2 
 
 
325 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00555058  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5210  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.66 
 
 
325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1371  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.54 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.544729  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1833  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  36 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.191683 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1814  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2810  alcohol dehydrogenase  32.92 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48867  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3728  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.73 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1621  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.42 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.463823  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1484  alcohol dehydrogenase  34.47 
 
 
322 aa  164  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0404  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.08 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0179654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0406  alcohol dehydrogenase  34.06 
 
 
326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262448  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0336  quinone oxidoreductase putative PIG3  32.72 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  0.594671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0924  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.12 
 
 
334 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.734202  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1171  alcohol dehydrogenase  36.02 
 
 
325 aa  162  6e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.356223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4233  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  34.05 
 
 
326 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0229616  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2099  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.17 
 
 
324 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.287009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4084  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.74 
 
 
326 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.406698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3286  quinone oxidoreductase  32.31 
 
 
321 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.635243  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3544  quinone oxidoreductase  32.31 
 
 
321 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.752673  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2774  alcohol dehydrogenase  34.38 
 
 
342 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3245  quinone oxidoreductase putative PIG3  31.79 
 
 
326 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2630  alcohol dehydrogenase  32.06 
 
 
339 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.317622 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3780  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.43 
 
 
334 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.107753  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0243  putative quinone oxidoreductase (NADPH) and Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
324 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2827  alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 
339 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.582411  normal  0.0605973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4208  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  33.74 
 
 
326 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0936  zinc-binding alcohol dehydrogenase  36.42 
 
 
327 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2229  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
340 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3391  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.53 
 
 
331 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116422  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3501  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  32 
 
 
321 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3027  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.95 
 
 
342 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2075  alcohol dehydrogenase  33.23 
 
 
322 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0219  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.62 
 
 
328 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3256  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  32.31 
 
 
321 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4076  alcohol dehydrogenase  36.66 
 
 
323 aa  157  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5622  NAD(P)H quinone oxidoreductase, PIG3 family  32.92 
 
 
323 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.915578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0954  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.55 
 
 
330 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.319163  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2843  zinc-binding alcohol dehydrogenase  32.95 
 
 
342 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3419  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.23 
 
 
331 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.816241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2932  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  32.66 
 
 
342 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1093  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  33.43 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1647  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
324 aa  156  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0257319  normal  0.741118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3909  alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 
331 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0317152 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3168  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  33.73 
 
 
331 aa  155  7e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3087  quinone oxidoreductase (NADPH:quinone reductase)  33.73 
 
 
331 aa  155  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2354  putative NADPH quinone oxidoreductase, zinc- containing  35.38 
 
 
324 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350138  normal  0.0818586 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1250  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
339 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2376  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.71 
 
 
322 aa  155  9e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0753  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
329 aa  155  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0095  alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
324 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1260  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
334 aa  155  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0899  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  34.15 
 
 
326 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2776  putative alcohol dehydrogenase  31.46 
 
 
319 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0707  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 
324 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2119  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.65 
 
 
361 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0428078  normal  0.0987257 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3186  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.03 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3406  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  33.43 
 
 
331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3438  alcohol dehydrogenase  34.03 
 
 
335 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0961  alcohol dehydrogenase  34.46 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00699995 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2406  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.15 
 
 
324 aa  154  2.9999999999999998e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>