21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2047 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2047  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  826    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000225878 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2941  hypothetical protein  52.28 
 
 		 395 aa  431  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3987  hypothetical protein  39.32 
 
 		 354 aa  252  1e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4988  hypothetical protein  35.71 
 
 		 284 aa  156  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  36.74 
 
 		 1411 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  31.23 
 
 		 977 aa  133  6.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1817  TPR repeat-containing protein  34.11 
 
 		 945 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.703136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3674  hypothetical protein  29.44 
 
 		 1381 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10921  NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G07460)  31.01 
 
 		 1602 aa  90.1  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5005  hypothetical protein  30.22 
 
 		 189 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  28.33 
 
 		 1478 aa  76.6  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1720  hypothetical protein  36.45 
 
 		 120 aa  72  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1719  hypothetical protein  42.57 
 
 		 217 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.680386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1848  hypothetical protein  27.07 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0922205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3057  hypothetical protein  25 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000245353  decreased coverage  0.000000000123111 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2101  hypothetical protein  21.49 
 
 		 673 aa  48.9  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02023  conserved hypothetical protein  25.52 
 
 		 304 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02326  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G14650)  26.82 
 
 		 664 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1228  hypothetical protein  31.2 
 
 		 193 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.067938  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1499  hypothetical protein  25.28 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687869 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  21.99 
 
 		 1146 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>