18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2013 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2013  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  723    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.352291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1126  hypothetical protein  35.4 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7133  hypothetical protein  35.31 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3336  glutathione S-transferase  28.95 
 
 		 362 aa  145  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0485  glutathione S-transferase  30.68 
 
 		 368 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.917959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2398  glutathione S-transferase-like protein  25 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.416741  normal  0.054689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2781  hypothetical protein  30.84 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250638 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0547  glutathione S-transferase  27.91 
 
 		 371 aa  103  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0471941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2406  hypothetical protein  27.03 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.309302  hitchhiker  0.000427749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1001  glutathione S-transferase, putative  29.87 
 
 		 241 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4304  glutathione S-transferase, putative  28.14 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0946  putative glutathione S-transferase  26.19 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.109666  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1137  putative glutathione S-transferase  24.05 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.234055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  28.25 
 
 		 264 aa  50.8  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2088  glutathione S-transferase-like protein  24.89 
 
 		 216 aa  49.7  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.828063  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  26.84 
 
 		 241 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 263 aa  46.2  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  32.67 
 
 		 241 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>