44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1555 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1555  membrane protein-like protein  100 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.508864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4124  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.21413  normal  0.564732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4740  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002425  membrane protein  59.26 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4479  hypothetical protein  64.29 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000217224 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03638  hypothetical protein  57.41 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3921  hypothetical protein  63.64 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.393778  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0309  membrane protein-like protein  58.62 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4341  hypothetical protein  61.82 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.561901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4359  hypothetical protein  61.82 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.182654  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4501  hypothetical protein  61.82 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.365447  normal  0.103968 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4304  hypothetical protein  61.82 
 
 		 67 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.402818  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4011  hypothetical protein  61.82 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.127403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3636  hypothetical protein  59.65 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000809005  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3919  hypothetical protein  61.82 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.472062  normal  0.020645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4031  membrane protein-like protein  56.9 
 
 		 73 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.300951  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4887  hypothetical protein  58.93 
 
 		 64 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3706  hypothetical protein  57.89 
 
 		 66 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00936717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4226  hypothetical protein  59.65 
 
 		 65 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3815  hypothetical protein  55.36 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.595164  normal  0.0528702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3116  hypothetical protein  50.77 
 
 		 94 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3486  membrane protein-like  52.73 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2063  phosphohistidine phosphatase SixA  50.91 
 
 		 62 aa  70.9  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.874636  normal  0.707991 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2845  hypothetical protein  53.7 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1242  membrane protein-like protein  49.12 
 
 		 73 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.582249 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2256  membrane protein-like protein  49.09 
 
 		 86 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0186977  normal  0.1342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1156  membrane protein-like protein  49.02 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0130404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1888  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02392  membrane protein-like protein  54.55 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.505323  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0490  hypothetical protein  54.9 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22320  hypothetical protein  48.15 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479342  hitchhiker  7.49803e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0749  membrane protein  50 
 
 		 83 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.90984  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3789  hypothetical protein  53.06 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000180132 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35050  hypothetical protein  43.75 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.120265  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0720  membrane protein-like protein  47.06 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.443615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2571  hypothetical protein  36.11 
 
 		 73 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106682  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3450  hypothetical protein  38.81 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205804  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4100  hypothetical protein  45.1 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.66536 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4741  hypothetical protein  44 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4856  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.522078  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0155  hypothetical protein  35.09 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000493853  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06000  hypothetical protein  31.43 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1771  hypothetical protein  35.85 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.55323e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3607  hypothetical protein  36.07 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214237  hitchhiker  0.00163709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>